Srovnávací standardy pro hodnocení klinických a epidemiologických dat v současné onkologii: vývoj metodiky a její verifikace na populačních datech

RNDr. Jan Mužík, Ph.D.

Doctoral thesis

Comparative standards for the evaluation of clinical and epidemiological data in oncology: methodical development and verification on population data

Abstract:

Nádorová onemocnění představují závažný zdravotní problém současné české populace, zvláště s ohledem na stále rostoucí počty nově diagnostikovaných pacientů ročně. Česká republika zaujímá v mezinárodním měřítku předním místa v incidenci a mortalitě těchto onemocnění. Příčiny vzniku řady nádorových onemocnění nejsou známy, a to i přes stále rozsáhlejší znalosti procesů nádorového zvratu a růstu. Jedním z velmi významných zdrojů informací při porozumění této problematice tak stále zůstává epidemiologie nádorových onemocnění, která umožňuje hodnotit populační zátěž a identifikovat její trendy, poukazovat na rizikové skupiny v populaci, hodnotit úspěšnost diagnostiky a léčby, predikovat počty léčených při plánování péče o nemocné atp. Zásadním předpokladem využití nádorové epidemiologie je však dostupnost dostatečně rozsáhlých a úplných populačních dat, jejich reprezentativnost a informační úplnost. Díky celopopulačnímu Národnímu onkologickému registru (NOR) standardizovaně vedenému od roku 1976 až do současnosti má Česká republika taková data k dispozici. Národní onkologický registr obsahuje údaje o všech zachycených novotvarech v české populaci včetně relevantních údajů o diagnostice a primární protinádorové léčbě onkologických pacientů a v současné době obsahuje přes 1,6 miliónu záznamů. Ještě v nedávné době však tato rozsáhlá data nebyla běžně dostupná odborné veřejnosti a nebyla známa úroveň jejich kvality, úplnosti a informační hodnoty. Dostupnost údajů o epidemiologii novotvarů v České republice byla dříve omezena pouze na publikace Novotvary každoročně vydávané Ústavem zdravotnických informací a statistiky ČR (ÚZIS ČR). Vzhledem k omezeným možnostem těchto publikací a k rostoucí potřebě využívat rozsáhlé údaje shromážděné v NOR byla v roce 2001 tato data se souhlasem ÚZIS poprvé zpřístupněna odborné onkologické veřejnosti zastupované vedením České onkologické společnosti ČLS JEP (ČOS) pro možnosti vlastního zpracování a využití. Zpracováním těchto dat byl pověřen Institut biostatistiky a analýz Masarykovy univerzity (IBA) a v rámci IBA byl hlavním analytikem dat NOR a dat o epidemiologii nádorů jmenován autor disertační práce RNDr. Jan Mužík. Disertace shrnuje originální práce autora a jeho příspěvek k vývoji zcela nového, mezinárodně konkurenceschopného managementu populačních onkologických dat ČR. Byly vytvořeny postupy pro zpracování těchto objemových dat, byly vyvinuty algoritmy kompletující informaci o stadiu onemocnění dle zaznamenaných hodnot (TNM, MKN a MKN-O klasifikace i s ohledem na jejich změny v čase) a následně algoritmy stratifikující pacienty do skupin podle jejich informační hodnoty a úplnosti dat. Výsledkem je definice referenčního souboru pacientů jako komparativního standardu pro hodnocení výsledků léčebné péče v onkologii na populační úrovni. Dále bylo provedeno kompletní vyhodnocení aktuální situace epidemiologie novotvarů v České republice a byly nastaveny základní komparativní standardy pro hodnocení populační onkologické zátěže (standard obsahuje trendy incidence, mortality a prevalence, mezinárodní srovnání, kumulativní riziko, věkovou strukturu, regionální zátěž a trendy stadií). S ohledem na nedostatečnou dostupnost těchto vysoce hodnotných dat pro odbornou i laickou veřejnost byly dále vyvinuty softwarové analytické nástroje zpřístupňující data NOR v uživatelsky přijatelné podobě pomocí interaktivních analytických nástrojů. V první generaci byl vyvinut software SVOD (Systém pro Vizualizaci Onkologických Dat) zpřístupňující kompletní sadu epidemiologických data, dat o diagnostice a léčbě zaznamenané v NOR. Tento software byl urč

Abstract:

ený především odborné veřejnosti. Ve druhé generaci byl následně vytvořen Portál epidemiologie nádorů v České republice (www.svod.cz), který v rozsahu základních komparativních standardů pro hodnocení populační onkologické zátěže zpřístupnil tato data nejširší veřejnosti včetně prezentace do zahraničí. Nejaktuálnějším výsledkem práce týmu vedeného autorem disertační práce je nová generace webových analytických nástrojů, publikovaná se zamřením na urologické malignity (www.uroweb.cz).

Abstract:

Malignant diseases are a serious health problem in the Czech population, particularly with regard to annually increasing numbers of newly diagnosed patients. In international comparisons, the Czech Republic is ranked in the top positions in the incidence and mortality of cancer. Causes of development of many types of cancer are not clearly known, despite a still more extensive knowledge of processes of tumor growth. One of the most important sources of information in understanding this issue still remains cancer epidemiology, which allows us to assess the population burden, to identify the risk populations, to evaluate the success of diagnosis and treatment and to predict the number of patients for the planning of cancer care, etc. An essential prerequisite for the use of cancer epidemiology is availability of sufficiently large and complete population data and representativeness and completeness of such information. The Czech Republic has such data available thanks to the population-based National Cancer Registry (NCR), which is consistently managed since 1976 until now. NCR contains data on all diagnosed neoplasms in the Czech population, including relevant data on the tumour diagnosis and primary treatment of cancer. The database of NCR currently contains over 1.6 million records. Even a few years ago this extensive data was not fully accessible for professionals; also its level of quality, completeness and informational value was unknown. Availability of data on the epidemiology of neoplasms in the Czech Republic was previously limited only to publications “Cancer Incidence in the Czech Republic” issued annually by Institute for Health Information and Statistics (IHIS). Due to the limited capabilities of these publications and the growing need to use the extensive data collected in the NCR in 2001 was this database made first time available (with agreement of IHIS) for the cancer care professionals (the steering committee of the Czech Society for Oncology). Institute of Biostatistics and Analyses, Masaryk University (IBA) was commissioned to process these data and the author of this dissertation started to develop standardized data management over full NCR data. In addition to the definition of data standards, new measures for data quality assessment and scientifically based analytic reporting had to be developed. This dissertation thesis summarizes original articles and contributions of the author to the development of procedures for processing of large epidemiology data sets, algorithms completing information on the disease stage according to the recorded values (TNM, ICD and ICD-O classifications with respect to their changes over time) and finally algorithms for stratification of patients according to their information value and completeness of the data. The results initiated definition of the reference data set of patients as the reference pool for comparative evaluation of health care outcomes in oncology at the population level. The comprehensive summary of the current epidemiologic situation in the Czech Republic was published and basic standards for the comparative assessment of the population burden by cancer were defined. The standards include quantification of trends in incidence, mortality and prevalence, procedures to prepare data for international comparisons, calculation of lifetime cumulative cancer risk, assessment of regional distributions and trends. With regard to the lack of availability of these highly valuable data for professionals and for the lay public as well, the author also contributed to the development of several software analytic tools, which made the NCR data available to the users in user friendly environment. The first generation of this software was system SVOD (System for Visualisation of Oncologic Data), which provided a complete set of epidemiological data and data on the diagnosis and treatment recorded in NCR. This software was designed mainly to professionals. In the second ge

Abstract:

neration a new Portal of cancer epidemiology of the Czech Republic (available from www.svod.cz) was developed based on web technology. In the last work the team headed by the author developed a specialized portal for analysis of data on urology malignancies (www.uroweb.cz). This novel tools makes accessible epidemiological data for the public, including presentations oriented abroad.

Keywords

novotvary, epidemiologie, analýza dat cancer, epidemiology, data analysis

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 4. 10. 2010

Thesis defence

• Date of defence: 10. 3. 2011
• Supervisor: doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Medicine

Doctoral programme / field:
Oncology (4-years) / Oncology