Studium dlouhých nekódujících RNA u nádoru močového měchýře

Bc. Renata Kleinová

Master's thesis

Study of long non-coding RNAs in bladder cancer

Abstract:

Nádor močového měchýře je nejčastějším onkologickým onemocněním močového ústrojí. Podle toho, zda nádor prorůstá do svaloviny močového měchýře, se tyto nádory dělí na invazivní a neinvazivní. Prognóza pacientů s neinvazivním typem je většinou příznivá, avšak pacienti často trpí relapsy onemocnění. Invazivní nádor močového měchýře je naproti tomu provázen špatnou prognózou s 5letým přežíváním méně než 50 %. Klíčem k novým terapeutickým přístupům je objasnění složité molekulární patogeneze stojící za touto malignitou. Dlouhé nekódující RNA (lncRNA) jsou zapojeny do regulace genové exprese a hrají důležitou roli i v molekulární patologii karcinomu močového měchýře. V této studii byla provedena expresní analýza 6 vybraných lncRNA (TUG1, HOTAIR, MALAT1, UCA1, GAS5, MEG3) u párových vzorků nádorové a nenádorové tkáně močového měchýře získaných od 49 pacientů podstupujících chirurgický zákrok pro invazivní karcinom močového měchýře. Hladina TUG1 (p < 0,0001) a HOTAIR (p = 0,0006) byla signifikantně zvýšená v tumoru oproti nenádorové tkáni, zatímco MEG3 (p = 0,044) byla v nádoru významně snížená. Míra exprese TUG1 (p = 0,0102) a MALAT1 (p = 0,0125) také korelovala s celkovým přežitím pacientů. Experimentální umlčení hladiny TUG1 u buněčné linie T-24 odvozené od karcinomu močového měchýře vedlo k významnému snížení proliferace a migrace buněk. Domníváme se proto, že lncRNA TUG1 by mohla sloužit nejen jako nový diagnostický a prognostický biomarker invazivního karcinomu močového mechýře, ale také jako potenciální terapeutický cíl.

Abstract:

Bladder cancer is the most common cancer of the urinary tract. Based on the invasivity of tumour into the muscle layer, bladder cancer can be divided into two major groups. Non-muscle invasive bladder cancers have favourable prognosis but frequently recur. Muscle invasive bladder cancers have poor prognosis with five-year survival <50%. To improve treatment, detailed understanding of the bladder cancer pathogenesis and its molecular biology is required. Long non-coding RNAs are important regulators of gene expression and thus play a critical role in the molecular pathology of the bladder cancer. In this thesis, we analysed expressions of 6 lncRNAs (TUG1, HOTAIR, MALAT1, UCA1, GAS5, MEG3) in 49 bladder cancer tissue samples and normal adjacent tissues. The expression levels of TUG1 (p < 0,0001) and HOTAIR (p = 0,0006) were significantly up-regulated in bladder cancer tissues compared with normal adjacent tissues, whereas expression of MEG3 (p = 0,044) was significantly down-regulated in bladder tissues. Up-regulated TUG1 (p = 0,0102) and MALAT1 (p = 0,0125) negatively correlated with overall survival time of patients. Cell proliferation inhibition and decreased motility were observed in TUG1 small interfering RNA-transfected bladder carcinoma T-24 cells. Our data suggest that TUG1 may serve as a new prognostic and diagnostic biomarker and it can be used as a potential therapeutic target for treating human bladder cancer.

Keywords

nádor močového měchýře, dlouhé nekódující RNA, TUG1, bladder cancer, long non-coding RNA

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 6. 1. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 10. 2. 2016
• Supervisor: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics