Multiple structure alignment and exploring protein binding sites – Bc. David Sehnal, Ph.D.
Bc. David Sehnal, Ph.D.
Master's thesis
Multiple structure alignment and exploring protein binding sites
Multiple Structure Alignment and Exploring Protein Binding Sites
Abstract:
Tato diplomová práce se zabývá přikládánim molekulárních struktur, převážně vazebných míst proteinů. Jsou prezentovány tři algoritmy: první pro přikládání páru tří-rozměrných struktur, druhý pro hledání párování atomů v proteinech a konečně třetí, umožňující přiložení libovolného množství struktur najednou. Poslední ze zmiňovaných algoritmů také umožňuje výpočet modelu zkoumaného vazebného místa. Součástí …moreAbstract:
This master’s thesis is focused on superimposing molecular structures, particularly protein binding sites. Three algorithms are presented: the first for superimposing a pair of threedimensional structures, the second for finding a pairing of atoms in protein structures, and, finally, the third for superimposing multiple structures at once. Furthermore, models of particular binding sites can be computed …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 6. 1. 2010
Identifier:
https://is.muni.cz/th/u0qtg/
Thesis defence
- Date of defence: 8. 2. 2010
- Supervisor: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
- Reader: prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Informatics / Theoretical Informatics
Theses on a related topic
- No theses on a related topic available.