Bc. Jana Applová

Bachelor's thesis

Segmentace DNA sekvencí ze sekvenátoru dle repetitivnosti a její vliv na další analýzy

Segmentation of sequencing read by repetitivness and its effect on downstream analyses
Abstract:
Tato práce se zaměřila na repetitivní sekvence v krátkých sekvencích z DNA sekvenátorů. Repetice totiž kromě jiného znesnadňují práci s biologickými sekvencemi. Byl vytvořen program, který určuje hranice repeticí a samotné sekvence rozděluje.
Abstract:
This thesis is focused on repetitive sequences in short sequences from DNA sequenators. It is that repetitions make work with biological sequences harder. A program that looks for borders of the repetitive elements and splits the sequences was created.
 
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 1. 2018

Thesis defence

  • Date of defence: 13. 2. 2018
  • Supervisor: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
  • Reader: Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D.

Citation record

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky