Segmentace DNA sekvencí ze sekvenátoru dle repetitivnosti a její vliv na další analýzy – Bc. Jana Applová
Bc. Jana Applová
Bachelor's thesis
Segmentace DNA sekvencí ze sekvenátoru dle repetitivnosti a její vliv na další analýzy
Segmentation of sequencing read by repetitivness and its effect on downstream analyses
Anotácia:
Tato práce se zaměřila na repetitivní sekvence v krátkých sekvencích z DNA sekvenátorů. Repetice totiž kromě jiného znesnadňují práci s biologickými sekvencemi. Byl vytvořen program, který určuje hranice repeticí a samotné sekvence rozděluje.Abstract:
This thesis is focused on repetitive sequences in short sequences from DNA sequenators. It is that repetitions make work with biological sequences harder. A program that looks for borders of the repetitive elements and splits the sequences was created.
Jazyk práce: Czech
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 3. 1. 2018
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/bnlsf/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 13. 2. 2018
- Vedúci: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
- Oponent: Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / odbor:
Applied Informatics / Bioinformatics
Práce na příbuzné téma
-
Analysis of the evolution of repetitive DNA sequences as part of phylogenomic studies
Mert Dogan -
Evolution of repetitive DNA sequences in the giant genomes of lilioid monocots (Liliaceae)
Kateřina Sobotková -
Telomerické repetice a jejich interaktom
Marcela Hrušková -
Analýza a mapování repetice Ema25 u tmavoskvrnáče vřesového \kur{Hypomecis atomaria} (Lepidoptera, Geometridae)
Marie KUBÍNOVÁ -
Robert Coover: Repetice a paralelní alternativy a transformace pohádek a mýtů
Kateřina Narwová -
Struktura d(GA) repetic stabilizovaných i-motivem
Aleš Novotný