Souvislost polymorfismu genu BDNF s vnímavostí k infarktu myokardu - genetická asociační studie u českých pacientů

Bc. Natálie MOTÁKOVÁ

Master's thesis

The relationship of BDNF gene polymorphism of gene BDNF with susceptibility to myocardial infarction ? genetic association study in Czech patients

Abstract:

Ischemická choroba srdeční (ICHS) a její manifestace, zejména infarkt myokardu (IM), jsou stále jednou z nejčastějších příčin smrti (nejen) v rozvinutých zemích. Kromě prokázaných zevních faktorů se na vzniku uvedených chorob podílí významně dědičné faktory. Mezi geny, o kterých se uvažuje vzhledem k jejich možné účasti na dědičné složce ICHS, patří i gen pro růstový faktor nervové tkáně BDNF (z angl. Brain Derived Neurotrophic Factor). Studie v čínské populaci navíc nedávno zjistila spojitost mezi variantou BDNF genu Val66Met a nestabilní anginou pectoris, která je jednou z manifestací ICHS. Cílem této diplomové práce proto bylo zjistit, zda existuje také souvislost mezi polymorfismem BDNF genu (konkrétně variantou Val66Met) a infarktem myokardu v české populaci. Do studie bylo zařazeno 217 českých pacientů s prodělaným IM a 180 zdravých jedinců, jež sloužili jako srovnávací kontrola. Genotypizace byla u všech jedinců provedena paralelně pomocí metod PCR-SSP (z angl. polymerase chain reaction with sequence specific primers) a RT-PCR (z angl. real-time polymerase chain reaction, modifikace TaqMan). Zjistili jsme, že se alelové, genotypové ani fenotypové frekvence polymorfismu BDNF rs6265 G/A (Val66Met) mezi skupinami pacientů s IM a kontrolních jedinců signifikantně nelišily. U pacientů s infarktem myokardu byla frekvence alely 66Met 18%, genotypu 66Met/Met 4% a podíl nosičů (fenotypová frekvence) pro alelu 66Met 31 %. Ve srovnávané skupině zdravých kontrol byly zjištěny tyto frekvence: 17% (alelová), 5% (genotypová) a 29 % (fenotypová) (hodnota p>0,05 pro všechna srovnání). Součástí práce byla také subanalýza srovnávající pacienty a kontroly zvlášť podle pohlaví. Ani v tomto případě nebyla zjištěna souvislost mezi BDNF polymorfismem Val66Met a IM. Závěrem lze tedy shrnout, že naše studie nezjistila souvislost mezi BDNF polymorfismem Val66Met a IM u české populace. Uvedený polymorfismus tedy pravděpodobně nehraje zásadní roli v dědičné složce IM, přinejmenším v české populaci. Výsledky práce byly publikovány v časopise s impakt faktorem.

Abstract:

Coronary Heart Disease (CHD) and its manifestations, particularly myocardial infarction (MI), still remain among the most important causes of mortality in the developed world. Apart from the known causative environmental factors, CHD is characterized by important heritable component. The gene encoding for Brain Derived Neurotrophic Factor (BDNF) is considered as one of the candidate genes with possible implication in the genetic susceptibility to CHD. Furthermore, the study in the Chinese population reported recently an association of BDNF gene variant Val66Met with another manifestation of CHD, namely unstable angina pectoris. The aim of the present thesis was, therefore, to investigate possible link between the BDNF gene variant Val66Met and myocardial infarction in the Czech population. The study included 217 Czech patients with MI and 180 healthy control subjects who served as a comparative control population sample. Genotyping was performed in all subjects by two methods in parallel: the PCR-SSP (polymerase chain reaction with sequence specific primers) and RT-PCR (real-time polymerace chain reaction, TaqMan). We found that the allele, genotype and phenotype frequencies of the polymorphism BDNF rs6265 G/A (Val66Met) did not significantly differ between the patients with MI and control subjects. In patients with MI the frequency of 66Met allele was 18%, the genotype 66Met/Met 4% and the carriage rate (phenotype frequency) of the 66Met allele corresponded to 31%. The frequencies BDNF Val66Met variants observed in the healthy control population were as follows: 17% (allele), 5% (genotype) and 29% (phenotype)(p> 0.05 for all comparisons). Subanalysis comparing MI patients and control subjects separately according to gender was also a part of the study. Even in these comparisons no relationship between the BDNF Val66Met and MI was found. In conclusion, this study did not found any association between BDNF Val66Met polymorphism and myocardial infarction in Czech population. Thus, this polymorphism does not probably contribute significantly to the genetic component of MI, at least in the Czech population. The results of this thesis were published in the journal with impact factor.

Keywords

Klíčová slova, Ischemická choroba srdeční, ateroskleróza, polymorfismus Val66Met, neurotrofiny, brain-derived neurotrophic faktor ( BDNF)

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 31. 7. 2012

Accessible from:: 31. 7. 2012

Thesis defence

• Supervisor: MUDr. František Mrázek, Ph.D.

PALACKÝ UNIVERSITY IN OLOMOUC

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Zoology