Methods for interactive analysis of Spatial Transcriptomics sequencing data – Bc. Vojtěch Máčala
Bc. Vojtěch Máčala
Bachelor's thesis
Methods for interactive analysis of Spatial Transcriptomics sequencing data
Methods for interactive analysis of Spatial Transcriptomics sequencing data
Abstract:
Cílem této práce je ukázat, jak lze využít informace o prostorovém uspořádání buněk ve spojení s jejich transkriptomickým profilováním k získání poznatků o tkáňovém prostředí a buněčných mechanismech. Práce popisuje současné nejmodernější přístupy a představuje interaktivní webovou aplikaci pro analýzu prostorových transkriptomických dat z platformy Visium. Aplikace umožňuje svému uživateli nakreslit …moreAbstract:
This thesis aims to demonstrate how information about the location of cells within the tissue paired with transcriptomic profiling can be used to gain insights into cellular environments and mechanisms. The thesis describes current state-of-the-art approaches and introduces an interactive web application for analyzing spatial transcriptomics data from the Visium platform. The application allows its …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 18. 5. 2023
Identifier:
https://is.muni.cz/th/z9tb7/
Thesis defence
- Date of defence: 29. 6. 2023
- Supervisor: Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
- Reader: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Informatics / Informatics
Theses on a related topic
- No theses on a related topic available.