Studium genetické variability druhů rodu Trifolium

Bc. Jana Simandlová

Master's thesis

Study of genetic variability within the Trifolium genus

Anotácia:

Rod Trifolium zahrnuje několik významných kulturních druhů s uplatněním v zemědělství. Jetel luční (T. pratense L.) patří vzhledem k vysokým výnosům kvalitní píce k nejvýznamnějším pícninám v České republice i v Evropě. Hlavním cílem šlechtění jetele lučního je v současné době zvýšení jeho nedostatečné vytrvalosti. Jednou z možných metod, jak tento znak zlepšit, je mezidruhová hybridizace s druhy tvořícími podzemní výběžky, jako je například jetel prostřední (T. medium L.). Hlavním cílem diplomové práce byla studie hybridního charakteru rostlin vzniklých po mezidruhové hybridizaci T. pratense x T. medium. Na cytogenetické úrovni byl u hybridního materiálu potvrzen odlišný počet chromozomů. Hybridní charakter byl zkoumán také prostřednictvím genomické in situ hybridizace a molekulární analýzy s využitím markerů SSR odvozených z jetele lučního. Markery SSR byly využity také pro hodnocení vnitrodruhové variability jetele lučního i jetele prostředního. V neposlední řadě byla práce zaměřena také na charakterizaci repetitivní frakce genomů jetele lučního i jetele prostředního pomocí bioinformatických přístupů, která vedla k odhalení odlišného podílu repetitivních sekvencí v genomech obou druhů.

Abstract:

Genus Trifolium comprises several species of considerable agricultural importance. Red clover (T. pratense L.) is a wide-spread high-yielding and high-quality fodder crop in the Czech Republic as well as in the rest of Europe. Breeding of red clover is aimed mainly at increasing persistance. This can be obtained through interspecific hybridization with species with a rhizomatous growth habit, such as zigzag clover (T. medium L.). The aim of this diploma thesis was to study hybrid nature of interspecific hybrids T. pratense x T. medium. Different chromosome counts were confirmed on the cytogenetical level. Hybrid nature was analyzed via genomic in situ hybridization as well as on molecular level using set of SSR markers derived from red clover. Set of SSR markers was also used for evaluation of intraspecific variability of T. pratense and T. medium. Last but not least, the thesis was focused on characterization of repetitive DNA of both red clover and zigzag clover by means of bioinformatics tools. Difference in proportion of repetitive DNA was observed between genomes of both species.

Kľúčové slová

Trifolium, jetel, mezidruhoví hybridi, genetická variabilita, clover, interspecific hybrids, genetic variability

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2013
• Vedúci: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics