Studium interakce rostlinných alkaloidů s nukleovými kyselinami

Bc. Kateřina Kolková

Bachelor's thesis

Study on interaction of plant alkaloids with nucleic acids

Anotácia:

V této bakalářské práci se zabývám studiem rostlinných alkaloidů califor-nidinu, escholtzinu a escholidinu a jejich interakcí s nekanonickými strukturami DNA, konkrétně G-kvadruplex a i-motiv. Metodou cirkulárního dichroismu byly naměřeny teploty tání u struktur DNA samotných a v přítomnosti alkaloidů, tep-loty následně porovnány. Afinita jednotlivých alkaloidů ke strukturám DNA byla porovnána pomocí kompetitivní dialýzy. Na základě výsledků bylo pozorováno, že escholidin stabilizoval i-motiv více než californidin, a zároveň dokázal stabili-zovat i G-kvadruplex.

Abstract:

In this thesis I am interested in study of plant alkaloids californidine, escholtzine and escholidine and their interaction with non-canonical structures of DNA, which are G-quadruplex and i-motif. Method of circular dichroism was performer to measure melting points of DNA structures and DNA structures at present time of alkaloids and these were compared. Affinity of each alkaloid to structures of DNA was found out by competitive dialysis. Results it was deter-mined that escholidine stabilized i-motif more than californidine and also the stabilization of G quadruplex was observed.

Kľúčové slová

californidin, escholtzin, escholidin, DNA, oligonukleotid, G-kvadruplex, i-motiv, cirkulární dichroismus, teplota tání

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 6. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 7. 2020
• Vedúci: doc. Mgr. Petr Táborský, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Veronika Dillingerová

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Chemistry / Analytical Chemist - Manager of Chemical Laboratory