Mechanismy udržování telomer u řas

Bc. Tereza Hasíková

Diplomová práce

Mechanisms of telomere maintenance in algae

Anotace:

Tato práce se v první části zabývá molekulární taxonomií zelených řas. Zástupci byli vybráni s ohledem na předpokládané změny v telomerových sekvencích. Pro ověření taxonomické identity byly sekvenovány ITS (Internal Transcribed Spacers) mezerníky. Pro fylogenetickou analýzu byly sekvenovány geny pro 18S ribozomální RNA malé ribozomální podjednotky u těch zástupců, jejichž sekvence nebyly dostupné v databázi GenBank. V druhé části práce byla srovnávána telomerázová aktivita v průběhu buněčného cyklu druhu Desmodesmus quadricauda. Nebyly zjištěny výrazné změny telomerázové aktivity metodou klasické TRAP (Telomerase Repeat Amplification Protocol), ani kvantitativní TRAP. Byly ale zaznamenány rozdíly v charakteru závislosti telomerázové aktivity u biologických replik, proto by pro zvýšení věrohodnosti výsledků bylo třeba provést změny v uspořádání experimentu. V poslední části je naznačena možná rozdílnost dvou kmenů řas identifikovaných jako druh Chloromonas actinochloris. Tato domněnka vychází z rozdílnosti ITS sekvencí a rozdílné schopnosti hybridizace s telomerovými sondami.

Abstract:

This diploma thesis deals with molecular taxonomy in green algae in the first part. All representatives were chosen with respect to supposed changes in telomeric sequences. Spacers ITS (Internal Transcribed Spacers) were sequenced to check the taxonomic identity of strains. Genes for 18S ribosomal RNA from small ribosomal subunit were sequenced for those strains, which did not have the sequence in the database and eventually the molecular phylogenetic analysis was conducted. In the second part, changes in telomerase activity during cell cycle of the species Desmodesmus quadricauda were measured. No visible changes in the activity were detected by the TRAP (Telomerase Repeat Amplification Protocol) method. On the other hand, two biological replicates had different pattern in telomerase activity during the cell cycle, so some changes in the experimental design should be done. In the last part the heterogenity of two algal strains identified as species Chloromonas actinochloris was suggested. This speculation comes out from heterogenity of ITS sequences and unequal ability of hybridization with telomeric probes.

Klíčová slova

telomery, telomerázová aktivita, zelené řasy, fylogenetická analýza, dendrogram, buněčný cyklus, gen pro 18S RNA malé ribozomální podjednotky, ITS mezerníky, telomeres, telomerase activity, green algae, phylogenetic analysis, cell cycle, 18S ribosomal RNA, ITS spacers

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 9. 6. 2011
• Vedoucí: Mgr. Eva Sýkorová, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika