Scheduling software for the parallel running of NGS analytical pipelines – Nicolas Mokriš
Nicolas Mokriš
Bachelor's thesis
Scheduling software for the parallel running of NGS analytical pipelines
Scheduling software for the parallel running of NGS analytical pipelines
Abstract:
Cílem práce je vyvinout software pro integraci genomických dat získaných sekvenováním nové generace. Vzniklý systém TaskRunner vystavuje API pomocí kterého lze zadávat nové úlohy a číst informace o dokončených sekvenacích a dostupných pipeline. TaskRunner interně spravuje kopírování potřebných dat a efektivní plánování a spouštění výpočetně náročných úloh. Práce popisuje problematiku, využité technologie …moreAbstract:
The goal of the thesis is to develop software for the integration of genomic data produced by next-generation sequencing. The resulting system TaskRunner provides an API for entering new tasks and reading information about the finished sequencing runs and the available pipelines. TaskRunner internally manages the copying of required data and effective planning and executing of computationally intensive …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 25. 5. 2021
Identifier:
https://is.muni.cz/th/dyr9s/
Thesis defence
- Date of defence: 30. 6. 2021
- Supervisor: Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
- Reader: RNDr. Lukáš Hejtmánek, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Informatics / Parallel and Distributed Systems
Theses on a related topic
-
Aplikační využití geodat z API geosociálních sítí a z API o COVID-19 s doporučovacím systémem při overtourismu
Filip Odvárka -
Investigating the role of API-polymer compatibility in the design of amorphous API-PLA/PLGA formulations
Anton Iemtsev -
Návrh API pro testování na úrovni Oracle databáze
Martin Sejkora -
GraphQL API Facade for IT Inventory Management Tool
Mário Novák