Studium diverzity izolátů fytoplazmy proliferace jabloně v České republice.

Monika STREJČKOVÁ

Bakalářská práce

Stady of apple proliferation phytoplasma diversity in the Czech Republic.

Anotace:

Fytoplazmy jsou prokaryontní organismy třídy Mollicutes. Dosud byly popsány na více než 800 rostlinných druzích. Mezi hospodářsky nejvýznamnější patří fytoplazma proliferace jabloně, která je řazena do ribozomální podskupiny 16Sr X-A (Apple proliferation, AP,´Candidatus Phytoplasma mali´). AP je považována za karanténní organismus v Evropě a v Severní Americe. Typické symptomy AP jsou: - výrazně zvětšené palisty, které mají morfologii pravého listu -řapík a čepel, okraj palistů je nepravidelně zoubkovaná - malé plody s méně semeny a horší chuťovou kvalitou - předčasné červenání listů, metlovitost, abnormální růst výhonů na podzim, opakované kvetení V předložené práci byla testována DNA vyizolovaná ze stromů podezřelých na přítomnost AP. Stromy pocházely z genofondu, z produkčních výsadeb i výsadeb drobných pěstitelů. Pro detekci fytoplazem byla použita polymerázová řetězová reakce (polymerase chain reaction, PCR) s následnou analýzou délkového polymorfizmu restrikčních fragmentů (restriction fragment length polymorphism, RFLP). Pro detekci a rozlišení subtypů fytoplazem AP se jeví jako uživatelsky nejvhodnější direct PCR s primery rpAP15f/ rpAP15r amplifikující DNA ribozomálních proteinů rpS3 a rpl 22 s následným restrikčním štěpením enzymem AluI.

Abstract:

Phytoplasmas are prokaryote organisms of the Mollicutes class. So far they have been described on more than 800 plant species. Apple proliferation phytoplasma, which classifies in the ribosomal subgroup 16Sr X-A (Apple proliferation, AP, ?Candidatus Phytoplasma mali?), belongs amongst the agriculturally most important phytoplasmas. AP is considered a quarantine organism in Europe and in North America. Common symptoms caused by AP are as follows: notably enlarged stipules, which are morphologically like real leaves ? they have petiole and lamina; the edge of the stipules is irregularly dentate small fruits with fewer seeds and reduced flavour quality premature reddening of leaves, witches' broom appearance, abnormal growth of shoots in the autumn, repeated blossoming DNA isolated from trees suspected to have AP present was tested in the presented thesis. The trees originated from the gene pool, mass production planting as well as from planting of small producers. To detect phytoplasma, the polymerase chain reaction (PCR) was used with the subsequent analysis of restriction fragment length polymorphism (RFLP). To detect and differentiate AP phytoplasma subtypes, direct PCR with primers rpAP15f/rpAP15r amplifying the DNA of ribosomal proteins rpS3 and rpl 22 with subsequent restriction breakdown by AluI enzyme.

Klíčová slova

fytoplazma, proliferace jabloně, příznaky, PCR, RFLP

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 4. 2011

Identifikátor: 20103

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 21. 6. 2011
• Vedoucí: Dr. Ing. Jana Fránová

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Zemědělská fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Zemědělství / Zemědělské biotechnologie