Genetické markery pro identifikaci kultivarů brusnice chocholičnaté (Vaccinium corymbosum)

Monika BALAŽÍKOVÁ

Bachelor's thesis

Genetic markers for the identification of cultivars of highbush blueberry (Vaccinium corymbosum).

Abstract:

V mé bakalářské práci rešeršního typu jsem charakterizovala druh brusnice chocholičnatá (Vaccinium corymbosum) a několik dalších významných druhů rodu Vaccinium, které jsou šlechtiteli často využívány ke křížení s brusnicí chocholičnatou. Popsala jsem také základy pěstování a pěstitelskou typologii kultivarů brusnice chocholičnaté. Především se ale v této práci zabývám charakteristikou mikrosatelitních markerů, které slouží pro identifikaci kultivarů druhů rodu Vaccinium, především kultivarů brusnice chocholičnaté. Popsala jsem zde 2 systémy mikrosatelitních markerů pro identifikaci kultivarů. První systém vycházel původně z 49 mikrosatelitních lokusů, z nichž bylo vybráno 28 polymorfních mikrosatelitních lokusů a ty byly použity k úspěšné identifikaci 71 kultivarů několika druhů rodu Vaccinium. Z těchto 28 mikrosatelitů autoři vybrali 9 mikrosatelitních lokusů, které měly spolehlivě hodnotitelný produkt bez artefaktů, a proto mají univerzální využití v rámci různých laboratoří. Druhý systém zahrnuje 11 polymorfních mikrosatelitních lokusů, podle kterých se dokáží spolehlivě identifikovat kultivary druhů rodu Vaccinium sekce Cyanococcus, kam patří brusnice chocholičnatá.

Abstract:

In my Bachelor thesis, there is characterized specie Vaccinium corymbosum and several types of species of genus Vaccinium which are most commonly crossed with this specie. The basics of breeding and cultivation typology of cultivars of V. corymbosum are there also described. However, primary aim of this thesis is description microsallite markers which can be used for identification of especially V. corymbosum cultivars. There are covered two systems of microsatellite markers for identification of mainly V. corymbosum cultivars. The first system was based on forty nine microsatellite locuses. It was selected twenty eight polymorphic microsatellite locuses and these were used to successfully identication of seventy-one cultivars of Vaccinium species. It was selected only nine microsatellite locuses. These have offered useful product without artifacts and it is predicted posibility of its universal application within various laboratories. The second system includes eleven polymorphic microsatellite locuses which are useful for reliable identification cultivars of species of genus Vaccinium section Cyanococcus.

Keywords

brusnice chocholičnatá, Vaccinium corymbosum, mikrosatelit, DNA, cross-species PCR amplifikace, genetické markery

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 7. 2021

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology