Aplikace bioinformatických přístupů pro analýzu struktury rostlinných genomů – Mgr. Petra Hloušková, Ph.D.
Mgr. Petra Hloušková, Ph.D.
Disertační práce
Aplikace bioinformatických přístupů pro analýzu struktury rostlinných genomů
Bioinformatic approaches for structural analysis of plant genomes
Anotace:
Vyšší rostliny jsou známé svou extrémní variabilitou ve velikosti genomu, způsobenou buďto polyploidií a/nebo proliferací repetitivních sekvencí. Kromě jaderného genomu rostlinné buňky obsahují extranukleární, chloroplastové a mitochondriální genomy. Zejména chloroplastové sekvence představují užitečný zdroj informací pro řešení fylogenetických vztahů na různých taxonomických úrovních. Prvním cílem …víceAbstract:
Land plants are well known for their extensive genome size variation. The genome size range is primarily caused by polyploidy and/or proliferation of repetitive sequences. In addition to the nuclear genome, plant cells contain extranuclear, chloroplast and mitochondrial genomes. In particular, chloroplast sequences are useful to resolve the phylogenetic relationships at different taxonomic levels. …víceKeywords
Rostlinný genom Variabilita ve velikosti genomu Repetitivní DNA Transpozibilní elementy Retrotranspozony Tandemové repetice Chloroplastová DNA Fylogenetika Assembly Identifikace repetic Sekvenování nové generace Plant genome Genome size variability Repetitive DNA Transposable elements Retrotransposons Tandem repeats Chloroplast DNA Phylogenetics Repeat identification Next generation sequencing
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 3. 3. 2020
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/cvbnu/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 24. 4. 2020
- Vedoucí: prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D.
- Oponent: Mgr. Eva Hřibová, Ph.D., Mgr. Vratislav Peška, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaDoktorský studijní program / obor:
Genomika a proteomika / Genomika a proteomika
Práce na příbuzné téma
-
Velikost kinetochoru ve vztahu k velikosti chromozomů
Klára Plačková -
Mezipopulační variabilita ve tvaru a velikosti otisků ruky: důsledky pro odhad pohlaví pravěkých umělců
Markéta JAROŠOVÁ -
Variabilita ve velikosti genomu a průduchů taxonů rodu orsej (Ficaria) v Evropě
Michaela KONEČNÁ -
Variabilita ve velikosti vajec a snůšek u bahňáků
Zuzana Košťálová -
Variabilita ve velikosti genomu vybraných druhů rodu Chenopodium
Zuzana Koňáková -
Vnitrodruhová variabilita u žaberních parazitů ryb
Martin Zach -
Variabilita velikosti kapek jeskynních skapů
Tomáš Hejduk -
Estimating the copy-number of chromosomes using next-generation sequencing data
Peter Guman