Možnosti inhibice RNA polymerázy včelích virů z řádu Picornavirales

Bc. Adam Kujan

Bachelor's thesis

Evaluating possibility to develop inhibitors of RNA polymerases of honeybee viruses

Abstract:

Honeybee belongs to economically and agriculturally most-important insects. It is involved in pollination of 84% of agricultural crops in Europe and in the world as well. Significant decrease of this pollinator endangers the stability of not only food industry, but also cosmetic and pharmaceutical industries. The decline in bee colonies is associated with viral infections connected mainly with Varroa destructor. These viruses are mostly representatives of the family Dicistroviridae and Iflaviridae of order Picornavirales. Suitable antiviral agents capable of halting the decline in bee colonies have not been found yet. This thesis deals with factors linked to the bee decline connected wih virus infection. Analysis of RNA polymerase showed the conservation of aminoacids critical for functioning of the protein between the studied viruses and poliovirus. Likewise, structural motifs are preserved as well. This data opens the possibility of using inhibitors of the RNA polymerase efficient against poliovirus.

Abstract:

Včela medonosná patrí medzi ekonomicky a hospodársky najvýznamnejší hmyz. Podieľa sa na opeľovaní 84% poľnohospodárskych plodín v Európe a podobne tomu je aj vo svete. Výrazné úbytky tohto opeľovača ohrozujú stabilitu nielen potravinárskeho, ale aj kozmetického a farmaceutického priemyslu. Pokles včelstiev je, okrem iného, spôsobený vírusovými infekciami a to hlavne v spojení s klieštikom včelím. Medzi tieto vírusy patria prevažne zástupcovia z čeľade Iflaviridae a Dicistroviridae, radu Picornavirales. Dosiaľ neboli nájdené vhodné protivírusové látky schopné zastaviť úbytok včiel spôsobený týmito infekciami. Táto práca sa zaoberá faktormi spôsobujúcimi úbytok včiel spojené s vírusovým ochorením. Analýza RNA polymerázy ukázala konzervatívnosť aminokyselín, kľúčových pre funkčnosť proteínu, medzi študovanými vírusmi a poliovírusom. Rovnako sú tak zachované aj štruktúrne motívy. Tieto dáta otvárajú možnosť použitia inhibítorov RNA polymerázy účinných u poliovírusu.

Kľúčové slová

včelie vírusy, Picornavirales, Dicistroviridae, Iflaviridae, Aparavirus, Cripavirus, kapsid, štruktúra, RdRp, inhibítory, sekvenčná analýza, štruktúrna analýza, včela medonosná, klieštik včelí, úbytok včiel, honeybee viruses, capsid, structure, inhibitors, sequence analysis, structural analysis, Apis mellifera, Varroa destructor, honeybee losses

Jazyk práce: Slovak

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2015
• Vedúci: Mgr. Pavel Plevka, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry