Využití moderních molekulárně-biologických metod v taxonomii prokaryot

Bc. Martin Řezanina

Bachelor's thesis

Application of modern molecular biology techniques in taxonomy of procaryotes

Anotácia:

Cílem této bakalářské práce je uvést stručný přehled a popis metod používaných v taxonomii prokaryot. V této oblasti došlo v posledních padesáti letech k velkému rozvoji. V práci je na úvod popsán obor taxonomie prokaryot a stručná historie vývoje taxonomických metod se zaměřením na metody molekulárně-biologické, zejména pak na sekvenování nové generace. Mezi hojně využívané molekulárně biologické metody patří zejména DNA-DNA hybridizace, analýza genu pro 16S rRNA, ribotypizace či multilokusová sekvenční analýza. Protože je současná taxonomie bakterií a archeí založena převážně na informacích obsažených v sekvenci DNA, jsou v práci popsány i nejnovější metody sekvenování DNA a jejich využití pro taxonomické účely.

Abstract:

The aim of this bachelor thesis is to state a brief summary and description of methods used in the taxonomy of prokaryotes. In this field occurred to a great development in the last fifty years. In thesis is described the field of taxonomy of prokaryotes in introduction and brief history of taxonomic methods, with focus on molecular-biology methods, especially for next-generation sequencing. Most used molecular-biology methods include, in particular DNA-DNA hybridization, analysis of the 16S rRNA gene, ribotyping or multilocus sequence analysis. As the current taxonomy of bacteria and archaea is based predominantly on information contained in the DNA sequence, the thesis describes the latest DNA sequencing methods and their use for taxonomic purposes.

Kľúčové slová

Taxonomie prokaryot, identifikace, klasifikace, 16S rRNA, molekulárně-biologické metody, MLSA, DDH, NGS, ANI, GBDP, MUMi

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 9. 6. 2016
• Vedúci: Mgr. Kamila Kýrová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Experimental Biology / Special Biology