Genetická analýza hormonálních regulací u Brassica napus

Mgr. Katarína Kuricová, Ph.D.

Bakalářská práce

Identification of sensor histidine kinases from Brassica napus

Anotace:

Cytokiníny sú rastlinné hormóny, ktoré vplávajú na mnohé aspekty rstlinného rastu a vývoja, vrátane delenia buniek, zakladanie meristému, apikálnej dominancie, deferenciácie listov a koreňa, starnutia, vývoja semien, fertility... Dráha prenosu cytokinínového signálu u Arabidopsis thaliana je pomenovaná ako dvojzložkový systém (TCS) a zahŕňa tri funkčné zložky: receptorové histidínkinázy (AHK), prenášače fosfátu obsahujúce histidín (AHP) a jadrové regulátory odpovede (ARR). Dvojzložkový systém je rozsiahlo u Arabidopsis študovaný. Boli popísané 3 AHK, 5 AHP a 22 ARR. Tieto zložky TCS boli identifikované tiež u kukurice (Zea mays) a ryže (Oryza sativa). V tejto práci navrhujem metódy identifikácie génov TCS u repky olejnej (Brassica napus) prostredníctvom počítačovej analýzy (nástroje bioinformatiky) a prostredníctvom funkčnej analýzy. Brassica napus je dôležitá poľnohospodárska plodina veľmi blízko príbuzná Arabidopsis. Pestuje sa ako krmovina, pre výrobu oleja pre človeka a tiež ako prímes do bionafty.

Abstract:

Cytokinins are the plant hormones that influance many aspects of plant growth and development, including cell division, shoot meristem initiation, apical dominance, leaf and root diferenciatiation, senescence, seed development, fertility... Arabidopsis cytokinin signal transduction pathway is named as two-component system, TCS, and involves three functional modules: receptor hostidine kinases (AHKs), histidine phosphotransfer proteins (AHPs) and nuclear response regulators (ARRs). TCS has been studied extensively in Arabidopsis thliana. Three Arabidopsis HK, 5 AHP and 22 ARR have been reported. These components have been identified also in Zea mays and Oryza sativa. In this report I propose the methods of identification the genes of TCS in Brassica napus, through a computational analysis (tools of bioinformatic) of Brassica sequence databases and through a functional genomic. Brassica napus, rapeseed, is an important agricultural crop, most closely related to Arabidopsis. Rapeseed is grown for the production of animal feed, vegetable oil for human consumption and biodiesel.

Klíčová slova

rastlinné hormóny, cytokiníny, cytokinínová dráha, dvojzložkový systém, receptorové histidínkinázy, CHASE doména, Brassica napus, bunková signalizácia, Arabidopsis thaliana, identifikácia génov, homológ, bioinformatika, bioinformatické metódy, metódy reverznej genetiky

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2008

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 23. 6. 2008
• Vedoucí: RNDr. Alena Kuderová, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika