Analýza genové exprese u smrku ztepilého

Barbora Nezbedová

Bakalářská práce

Gene expresion analysis of Norway spruce

Anotace:

V bakalářské práci s názvem Analýza genové exprese u smrku ztepilého je vypracována podrobná literární rešerše obecně-metodického rozboru přístupů k analýze genové exprese se zaměřením na smrk ztepilý a specifické produkty genové exprese (dehydriny). U dehydrinů se předpokládá spojitost s odolností smrku vůči významným abiotickým stresovým faktorům, jejichž společným jmenovatelem jsou především nevyhovující hydrické poměry stanoviště. Součástí rešeršní části práce je taktéž dendrologická, ekologická a genetická charakteristika zájmového druhu a detailní rozbor vědecké literatury zabývající se dehydriny.Ve výzkumné části práce je navržena metodika pro zpracování a analýzu genové exprese, konkrétně izolace RNA, ověření kvalitativních a kvantitativních parametrů a její zpětný přepis do cDNA. Následně byla s využitím vybraných dehydrinových primerů testována a optimalizována metoda RT-qPCR (kvantitativní polymerázová řetězová reakce v reálném čase).

Abstract:

This bachelor thesis, entitled “Gene expresion analysis of Norway Spruce”, contains a detailed literature review of general-methodical analysis of approaches to gene expression analysis focused on Norway Spruce and specific gene expression products (dehydrins). Dehydrins are associated with the resistance of the spruce to significant abiotic stress factors, the common denominator of which are the predominantly unsuitable hydrological habitat conditions. In addition, the review part of the thesis includes the dendrological, ecological and genetic characteristics of the species of interest, and a detailed analysis of the scientific literature dealing with dehydrins.In the research part of the thesis, methodology for processing and analysis of gene expression is proposed, namely isolation of RNA, verification of qualitative and quantitative parameters and its reverse transcription into cDNA. Subsequently, the RT-qPCR method (quantitative real-time polymerase chain reaction) was tested and optimized using selected dehydrin primers.

Klíčová slova

genová exprese, dehydriny, RT-qPCR, Picea abies [L.] Karst., smrk ztepilý, abiotický stres

Keywords

gene expresion, dehydrins, RT-qPCR, Picea abies [L.] Karst., Norway Spruce, abiotic stress

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Jiří Korecký, Ph.D.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta lesnická a dřevařská

Bakalářský studijní program / obor:
Environmentální vědy / Aplikovaná ekologie