Analýza interakce mezi rostlinou a mikrobem pomocí omických přístupů

Bc. Veronika Malých

Master's thesis

Omics analysis of plant-microbe interaction

Anotácia:

Rostliny vyvinuly složité aktivní i pasivní mechanismy, aby se dokázaly vyrovnat s biotickými interakcemi. Teoretická část práce shrnuje interakci rostlin s endofytickými houbami a zdůrazňuje roli endosymbiotických organismů v rámci biologické kontroly. Experimentální část se skládá ze dvou nezávislých experimentů. Nejprve byl analyzován proteom a metabolom endofytické houby Acremonium alternatum, přičemž byly současně porovnány profily spor a mycelia. Dále byla hostitelská rostlina Arabidopsis thaliana inokulována sporami A. alternatum. Kombinace doplňujících se analýz odhalila, že A. alternatum pozměňuje signalizaci cytokininů hostitelských rostlin, přičemž výsledek této interakce závisí na přítomnosti sacharosy.

Abstract:

Plants have developed a complex mixture of active and passive mechanisms to cope with biotic interactions. The theoretical part of this thesis reviews plant interactions with endophytic fungi and highlights the role of endosymbionts in biological control. The experimental part consists of two independent sets of experiments. First, proteome and metabolome of endophytic fungi Acremonium alternatum were analyzed, and profiles of spores and mycelium were compared. Next, plant host, Arabidopsis thaliana was inoculated with A. alternatum spores. The combination of complementary analyses revealed that A. alternatum alters host cytokinin signalling and the output of interaction is sucrose-dependant.

Kľúčové slová

RT-qPCR, metabolom, A. alternatum, proteom, morfologie, fyziologie, cytokininy

Keywords

morphology, A. alternatum, physiology, cytokinins, metabolome, RT-qPCR, proteome

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 5. 5. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Mgr. Martin Černý, Ph.D.

Mendel University in Brno

Faculty of AgriSciences

Master programme / odbor:
Plant Production / Plant Biotechnology