Příprava zhrubeného modelu cytochromu P450 3A4 – Zuzana KOUKALOVÁ
Zuzana KOUKALOVÁ
Bachelor's thesis
Příprava zhrubeného modelu cytochromu P450 3A4
Preparation of coarse-grained model of cytochrome P450 3A4
Abstract:
V této práci byly připraveny zhrubené modely systému cytochromu P450 3A4 na různých membránách složených z lipidů DOPC, DOPE a DOPG. Prostřednictvím molekulárně dynamických simulací za použití silového pole Martini byly nejdříve analyzovány strukturní parametry samotných membrán např. plocha, kterou zaujímá jeden lipid, tloušťka membrány či stupeň uspořádanosti lipidů. Poté bylo studováno chování na …moreAbstract:
In this study we prepared coarse-grain models of membrane-bound cytochrome P450 3A4 on membrane of different lipid composition, such as DOPC, DOPE and DOPG. Using molecular dynamics techniques and Martini lipid force field we analyzed structural parameters of membranes such as area per lipid, bilayer thickness and order parameters. Then, behaviour of membrane attached cytochrome P450 was studied. Results …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 8. 2018
Thesis defence
- Supervisor: Mgr. Martin Šrejber
Citation record
The right form of listing the thesis as a source quoted
KOUKALOVÁ, Zuzana. Příprava zhrubeného modelu cytochromu P450 3A4. Olomouc, 2018. bakalářská práce (Bc.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakultaPALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Chemistry / Applied Chemistry
Theses on a related topic
-
Vytvoření nové struktury membránoveho nanodisku pomocí počítačových simulaci
Tereza Gerguri -
Multiscale simulations of protein-protein interactions
Miroslav Jurásek -
Vazebná místa na ikosahedrální virové kapsidě
Veronika Schubertová -
Průchod komplexních peptidů přes fosfolipidové membrány
Ladislav Hustý -
Nová potenciální léčiva přírodního původu a jejich vliv na cytochrom P450 v preklinickém modelu
Kristýna Nosková -
Simulace Cytochrom P450 reduktázy
Martin ŠREJBER -
Exprese cytochromu P450 1B1 v normálních a nádorových buňkách
Jana Svobodová
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights