Program pro analýzu smíšených sekvenačních chromatogramů. – MUDr. Ladislav Špringel
MUDr. Ladislav Špringel
Bachelor's thesis
Program pro analýzu smíšených sekvenačních chromatogramů.
Computer program for analysis of mixed sequencing chromatograms.
Abstract:
Common problem of clinical samples sequencing are mixed chromatograms. Such chromatograms occur because of sequencing of polymicrobial samples. This problem can be sloved by labor-intensive laboratory approach or expensive computational approach by using commertial tool RipSeq Mixed. Result of this bachelor thesis is computer program 16S DeMixer designed according to the requirements of the Genetics …viacAbstract:
Výskyt zmiešaných sekvenačných chromatogramov je častým problémom pri sekvenovaní klinických vzoriek. Takéto chromatogramy vznikajú predovšetkým u typických polymikrobiálnych vzoriek, ako je napríklad sputum, bronchoalveolárna laváž či stery zo slizníc. Tento problém je riešiteľný laboratórne izolovaním jednotlivých kmeňov baktérií a opätovným sekvenovaním alebo pomocou komerčného nástroja RipSeq Mixed …viac
Jazyk práce: Slovak
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 29. 5. 2017
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/nuov9/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 27. 6. 2017
- Vedúci: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
- Oponent: Ing. Jiří Hon
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / odbor:
Applied Informatics / Bioinformatics
Práce na příbuzné téma
- Žádné práce na příbuzné téma.