Optimalizace genetické analýzy pro výsledky hodnocení JUT metodou SEUROP u masného skotu

Bc. Lenka Ryšavá

Master's thesis

Optimization of genetic analysis for the results of the carcass weight evaluation by method SEUROP in beef cattle

Abstract:

Zvyšující se trend v chovu masného skotu v České republice je doprovázen vývojem nových genetických hodnocení a jejich neustálou optimalizací, která zaručí aktuálnost odhadovaných parametrů. Práce se zabývá optimalizací genetické analýzy pro hodnocení JUT metodou SEUROP u masných plemen skotu. Krom stručného souhrnu o stavech skotu v ČR je zde pojednáno o masné užitkovosti a využití SEUROP metody v ČR a v některých evropských zemích. Jako závislé proměnné byly ve studii zvoleny jatečné znaky: hmotnost JUT, zmasilost a protučnělost. Nezávislými proměnnými byly zvoleny jako fixní efekty: věk při porážce, heterózní efekt, pohlaví, plemeno, kategorie JUT a klasifikátor. Jako náhodné efekty stádo-rok-období-jatka a plemenná hodnota jedince. K jedincům byl vytvořen 4 generační rodokmen se skupinami neznámých rodičů podle zemí původu. K odhadu genetických parametrů byla použita metoda REML. Většina nezávislých proměnných byla do modelu odhadnuta jako statisticky významná pro všechny závislé proměnné (P<0,0001), vyjma heterózního efektu, který byl neprůkazný u protučnělosti. Genetické, reziduální a fenotypové variance pro hmotnost JUT se pohybovaly v hodnotách 2084, 1431 a 4104. Pro zmasilost pak nabývaly hodnot 0,16, 0,21 a 0,41 a pro protučnělost 0,15, 0,21 a 0,40. Koeficienty dědivosti byly pro hmotnost JUT 0,51, pro zmasilost 0,38 a pro protučnělost 0,39, přičemž korelace mezi jednotlivými proměnnými byly: velmi silná mezi hmotností JUT a zmasilostí (r = 0,71) a slabá mezi hmotností JUT a protučnělostí (r = 0,16) i mezi protučnělostí a zmasilostí (r = 0,11). Výsledky jsou porovnatelné s některými předchozími studiemi a je tedy možné využívat odhadnuté genetické parametry v praxi.

Abstract:

The increasing trend in beef cattle in the Czech Republic is accompanied by the development of new genetic evaluation and its optimalization to ensure that data from the estimated parameters are actual. This study deals with optimalization of the genetic analysis for the carcass weight evaluated by SEUROP method for beef cattle. In addition, a brief summary of a number of cattles in the Czech Republic is being mentioned, while thereafter the thesis deals with the meat performance and the use of SEUROP method in the Czech Republic as well as in some other European countries. Dependent variables were chosen: carcass weight, conformation score and fatness score. As independent variables, age at slaughter, heterosis, sex, breed, carcass category and classifier as the fixed effects were chosen. Random effects were herd-year-season-abattoir (HYSA) and individuals. For the individuals four generation pedigrees of ancestors with unknown parents groups according to origin have been created. For an estimate of genetic parameters a REML method was used. Most of the independent variables were estimated as statistically significant for all the dependent variables (P<0,0001) in the model, except heterosis, which was not significant in fatness score. Genetic, residual and phenotypic variance for carcass weight were estimated and their values are 2084, 1431 and 4104. For the carcass conformation 0,16, 0,21 and 0,41 and for the fatness score are 0,15, 0,21 and 0,40. Estimated heritability for the carcass weight were 0,51, 0,38 for the carcass conformation and 0,39 for the fatness score. The correlations between variables were: very strong between carcass weight and conformation (r = 0,71) and weak between carcass weight and fatness score (r = 0,16) and also between conformation and fatness score (r = 0,11). The results are quite comparable to other previous studies and the estimated genetic parameters can be used in praxis.

Keywords

genetické korelace, genetické parametry, prostřeďové efekty, SEUROP, masný skot, dědivost

Keywords

genetic correlation, genetic parameters, variance components, SEUROP, beef cattle, heritability

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 19. 4. 2017

Thesis defence

• Supervisor: doc. Ing. Luboš Vostrý, Ph.D.

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Master programme / field:
Genetic Technologies and Breeding / Animal Breeding