Metody pro výpočet poloh atomů vodíků v proteinech – Bc. Šimon Zouvala
Bc. Šimon Zouvala
Master's thesis
Metody pro výpočet poloh atomů vodíků v proteinech
Methods for calculation of hydrogen atom coordinates in proteins
Abstract:
{V této diplomové práci se věnujeme metodám výpočtu souřadnic vodíků v proteinových strukturách. Atomy vodíků tvoří téměř polovinu všech atomů ve struktuře proteinu a hrají důležitou roli pro některé druhy aplikací, například výpočet parciálních atomových nábojů. V proteinových strukturách však často chybí vodíky, jelikož velká část struktur v Protein Data Bank je stanovena metodami rentgenové krystalografie …moreAbstract:
In this thesis, we deal with methods for calculating the coordinates of hydrogen atoms in protein structures. Hydrogen atoms make up almost half of all atoms in the protein structure and play an important role in some types of applications, such as the calculation of partial atomic charges. However, hydrogens are often absent in structures, as much of the structures found in the Protein Data Bank are …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 31. 5. 2021
Identifier:
https://is.muni.cz/th/fs523/
Thesis defence
- Date of defence: 8. 7. 2021
- Supervisor: RNDr. Tomáš Raček, doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- Reader: doc. RNDr. Karel Berka, Ph.D.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Parciální atomové náboje peptidů
Ondřej Schindler -
Parciální atomové náboje peptidů
Ondřej Schindler -
Parciální atomové náboje na proteinech
Ondřej Schindler -
Vliv 3D struktury molekul na kvalitu predikce pKa
Stanislav Geidl -
The visualization of secondary structure elements of proteins in 2D
Ivana Hutařová Vařeková -
The visualization of secondary structure elements of proteins in 2D
Ivana Hutařová Vařeková -
Počítačový návrh léků: Kvantově-mechanická studia komplexů mezi proteiny a ligandy a proteiny, ligandy a vodou
HARESH BABUBHAI AJANI -
Proteiny rodiny Myb – nové úlohy v tumorigenezi a nádorové progresi
Monika Dúcka