Studium molekulových interakcí v ribosomální RNA a ribozymech – Mgr. Petr Stadlbauer, Ph.D.
Mgr. Petr Stadlbauer, Ph.D.
Bakalářská práce
Studium molekulových interakcí v ribosomální RNA a ribozymech
Analysis of molecular interactions in ribosomal RNA and ribozymes
Anotace:
V této bakalářské práci se věnujeme studiu motivu four–way junction rodiny cH, který byl vystřižen z ribosomální RNA z helixů 94 – 97 a mediátorové RNA HCV IRES. Ke studiu byly použity techniky molekulové dynamiky. Analýza pohybů ukazuje dýchání helixů a anisotropní pohyb ramen vůči ostatním. Původcem pohybů jsou v řadě případů nespárované nukleotidy centrální smyčky. Stabilizační vliv na strukturu …víceAbstract:
In this thesis we study family cH of four-way junctions, coming from helices 94 – 97 of rRNA of the large ribosomal subunit and from mRNA of the HCV IRES. We used molecular dynamics simulations. The analysis of motions shows breathing of the helices and anisotropic movement of one or two helices with respect to the others. This may be caused by bulged nucleotides of the central loop. Interactions between …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2011
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/pdfaa/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 14. 6. 2011
- Vedoucí: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie
Práce na příbuzné téma
-
Charakterizace lidských RNA-vazebných proteinů v úpravách a degradaci RNA
Ivana Cavallin -
Charakterizace kvasinkových jaderných RNA-vazebných proteinů v úpravách a degradaci RNA.
Eva Tikalová -
Ověření promotorových oblastí HrdB sigma faktoru RNA polymerázy a exprese příslušných RNA ve streptomycetách
Adéla MIKULOVÁ -
Simulace komplexu RNA-dependentní RNA-polymerasy s potenciálním ligandem
Kristina Knopfová -
Modeling of interactions of RNA-dependent RNA polymerase from SARS CoV-2 with selected ligands
Lamija Zijadic -
Vliv aminokyselinových substitucí na aktivitu RNA-dependentní RNA polymerázy SARS-CoV-2
Klára Kušková