Stochastická charakterizace odezvy feromonové signální dráhy na dávky feromonu

Jana RACHOVÁ

Bakalářská práce

Stochastic characterisation of the yeast pheromone pathway dose response

Anotace:

Ve všech živých organismech se vyskytuje biologický šum projevující se náhodnými výchylkami v úrovni genové exprese. Za určitých podmínek může zvýšená variabilita genové exprese vést ke vzniku onemocnění. Mezi takovéto rizikové faktory patří ztráta jedné funkční kopie genu. Tato práce se zabývá studiem vlivu tohoto faktorů na stochastickou odezvu feromonové signální dráhy v kvasinkách. Dále je studován vliv genetické modifikace klíčového komponentu feromonové signální dráhy nukleárního transkripčního faktoru na stochastickou odezvu této dráhy. Je ukázáno, že přirozený transkripční faktor dokáže potlačovat náhodné změny signálu. Syntetický transkripční faktor tuto schopnost nemá.

Abstract:

The biological noise is present in all living organisms. It manifests as the stochasticity of gene expression. Increased gene expression noise can lead to disease onset under certain circumstances including the loss of one functional copy of the gene. This work study the effect of this factor on the stochastic response of the yeast mating pheromone signal pathway. Further, the effect of genetic modification of a key pathway component nuclear transcriptional factor on the stochastic response of this pathway is studied. It is shown that the wild-type transcriptional factor is able to suppress the stochastic fluctuations in signal. The synthetic transcription factor do not perform this ability.

Klíčová slova

šum v genové expresi, stochastick á charakterizace, feromonov á sign alní dr áha kvasinek

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 8. 2016

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Daniel Georgiev, PhD.

ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI

Fakulta aplikovaných věd

Bakalářský studijní program / obor:
Inženýrská informatika / Systémy pro identifikaci, bezpečnost a komunikaci