Příbuzenská plemenitba u australských kelpií v ČR

Adéla Malinovská

Bachelor's thesis

Inbreeding in Australian kelpies in the Czech Republic

Abstract:

Cílem této práce bylo zhodnotit úroveň příbuzenské plemenitby u australských kelpií v České republice a ověřit vliv její intenzity na velikost vrhů. Za příbuzenskou plemenitbu (neboli inbreeding) považujeme páření mezi zvířaty, která mají alespoň jednoho společného předka v rodokmenu (v praktickém chovu do páté generace). Chovatelé tento způsob plemenitby využívají, především pokud chtějí v populaci zvířat upevnit žádoucí znak. S využitím příbuzenské plemenitby jsou však spojena i určitá rizika, která souvisejí se zvyšováním homozygotnosti. Tento jev se nazývá inbrední deprese a projevuje se nejčastěji zhoršením funkčních vlastností (fitness, adaptabilita, životaschopnost, dlouhověkost), v určitých případech může dojít i k vyštěpení recesivně podmíněných vad a onemocnění. Pro analýzu byla použita data získaná z Kennel Meringa's Online Kelpie Database. Byly hodnoceny vrhy narozené v letech 2003–2021. Jako kritérium intenzity příbuzenské plemenitby byl použit Wrightův koeficient inbreedingu (Fx) stanovený na základě pětigeneračního rodokmenu. Celkově byl koeficient příbuzenské plemenitby stanoven u 664 jedinců, pocházejících ze 116 vrhů. Statistické vyhodnocení a grafická vizualizace výsledků byla provedena pomocí softwaru Statistica (verze 12, Statsoft, ČZU). Pro ověření poměru pohlaví v jednotlivých vrzích byl použit chí-kvadrát test. Pomocí analýzy rozptylu bylo ověřováno, zda na hodnoty koeficientu inbreedingu má vliv rok narození jedince a chovatelská stanice. Dále bylo pomocí analýzy rozptylu ověřováno, zda má úroveň příbuzenské plemenitby vliv na počet štěňat ve vrhu. Průměrný počet štěňat ve vrhu byl 5,7 ± 1,8. Poměr pohlaví se statisticky významně nelišil od poměru 1:1 ( χ2 = 0,13). Zjištěné hodnoty koeficientu inbreedingu (Fx) se ve sledované populaci pohybovaly v rozmezí 0 - 0,10, střední hodnota byla 0,01. Ze získaných dat nebyl zjištěn statisticky významný vliv inbreedingu na velikost vrhu, prokázal se však rozdíl mezi uchovněnými a neuchovněnými jedinci, kdy uchovnění jedinci vykazovali statisticky významně nižší střední hodnotu koeficientu inbreedingu. Střední hodnoty koeficientu inbreedingu se v průběhu let zvyšovaly, nepřekročily však doporučenou hranici 10 %. Vliv chovatelské stanice nebyl prokázán. Ze získaných výsledků lze konstatovat, že intenzita příbuzenské plemenitby je ve sledované populaci stále relativně nízká, v populaci nebyly zaznamenány žádné zjevné příznaky inbrední deprese. Do budoucna je však určitě vhodné situaci dále monitorovat a dodržovat obecně platné zásady k zamezení ztráty genetické diverzity (např. omezení počtu vrhů od jednotlivých krycích psů). Bylo by také vhodné ověřit možnost vlivu příbuzenské plemenitby na další vlastnosti, např. délku života nebo výskyt geneticky podmíněných onemocnění.

Abstract:

The goal of this paper was to evaluate the level of inbreeding of Australian Kelpies in the Czech Republic and the influence of its intensity on the size of litters. What is considered inbreeding, is breeding between animals that have at least one common ancestor (up to 5 generations back in the context of practical breeding). Breeders use this breeding method especially when they want to reinforce desirable traits in the animal population. However, certain risks, related to increase in homozygosity, are linked with inbreeding. This phenomenon is called inbreeding depression and manifests itself most often in worsening of functional characteristics, such as fitness, adaptability, vitality, or longevity. In certain cases, it can lead to excision of recessive defects and diseases. Data collected from Kennel Meringa's Online Kelpie Database was used for the analysis, with litters born between 2003-2021 being the focus. Wright’s coefficient of inbreeding (Fx), based on a five-generation pedigree, was used as a criterium for the intensity of inbreeding. In total, the coefficient was determined in 664 individuals from 116 litters. The software used for statistical evaluation and graphic visualisation of the results was Statistica (ver. 12, Statsoft, ČZU). To verify the ratio of sexes among individual litters, the chi-squared test was used. By the means of dispersion analysis, it was determined whether the inbreeding coefficient value was influenced by an individual’s date of birth and breeding kennel. Further, it was examined whether the levels of inbreeding influenced the number of puppies in a litter. The average number of puppies in a litter was 5,7 ± 1,8. The ratio of the sexes did not significantly divert from the 1:1 ratio (χ2 = 0,13). The determined values of the inbreeding coefficient (Fx) ranged from 0 to 0.10 in the observed population, the mean value being 0.01. From the collected data, any notable influence on inbreeding on the size of litters was not observed, however, the difference between individuals with and without breeding certification was noteworthy. In the case of individuals with a breeding certificate, the inbreeding coefficient values were statistically significantly lower. Although, mean values of the inbreeding coefficient have been going up throughout the years, they have never surpassed the recommended 10 % limit. The influence of breeding kennels could not be proven. Based on the collected data, it can be said that the intensity of inbreeding in the observed population is still quite low, and no obvious symptoms of inbreeding depression were registered. However, it is certainly appropriate to continue monitoring the situation in the future, as well as abiding by the general principles of preventing the loss of genetic diversity (e.g., limiting the number of litters from a single stud dog). It would also be appropriate to inspect the possibility of inbreeding’s influence on other characteristics, such as length of life or occurrence of genetically determined diseases.

Keywords

koeficient příbuzenské plemenitby, australská kelpie, rodokmenová analýza, inbrední deprese, chovatelství

Keywords

inbreeding coefficient, australian kelpie, pedigree analysis, inbreeding depression, breeding

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 4. 2022

Thesis defence

• Supervisor: Ing. Barbora Hofmanová, Ph.D.

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Bachelor programme:
Cynology