Vlivu RAD51AP1 proteinu na RAD51-zprostředkovanou homologní rekombinaci

Mgr. Diego Matia Antonio Fossatti Jara

Master's thesis

The effect of RAD51AP1 protein on RAD51-mediated homologous recombination

Anotácia:

Homologní rekombinace (HR) je bezchybná cesta opravy dvouřetězcových zlomů DNA, která pomáhá udržovat integritu genomu. Aby byla zajištěna přesná oprava, její mechanismus závisí na přítomnosti homologní sekvence v genomu, která kopíruje chybějící informaci. RAD51 představuje klíčový enzym pro HR, ale vyžaduje také mnoho akcesorních proteinů, které regulují aktivitu RAD51. Mezi nimi RAD51AP1 představuje pozitivní regulátor, který stimuluje aktivitu RAD51. Molekulární mechanismus působení RAD51AP1 však není zcela objasněn. Tato diplomová práce se proto zaměřuje na charakterizaci RAD51AP1 v různých krocích HR zprostředkované RAD51 s cílem objasnit jeho význam pro stabilitu genomu. Tato diplomová práce ukazuje, že RAD51AP1 stabilizuje vlákno RAD51-ssDNA, podporuje párování a vytěsnění reakce výměny vláken zprostředkované RAD51 a stabilizuje produkt D-smyčky zprostředkované RAD51.

Abstract:

Homologous Recombination (HR) is an error-free pathway for DNA double-strand break repair that helps to maintain genome integrity. It depends on a homologous sequence found on a sister chromatid to copy the missing information, leading to highly accurate repair. Although RAD51 is the key enzyme for HR, many RAD51 accessory proteins are needed for the appropriate activity of RAD51 in HR. RAD51AP1 is a protein that stimulates RAD51 activity in HR. However, the mechanism of action of RAD51AP1 in HR is not fully understood. This diploma thesis focuses on the characterization of RAD51AP1 in different steps of HR in order to elucidate its importance for genomic stability. This thesis shows that RAD51AP1 stabilizes the RAD51-ssDNA filament. Moreover, RAD51AP1 promotes the pairing and displacement steps of the strand exchange reaction and RAD51AP1 stabilizes the RAD51-mediated D-loop formation.

Keywords

RAD51, RAD51AP1, Homologous Recombination, DNA Strand Exchange, D-loop

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 31. 5. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 24. 6. 2021
• Vedúci: doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Marek Šebesta, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Biomolecular chemistry