Populačně genetické postupy při analýze rodokmenu psů

Lucia Baránková

Bakalářská práce

Population genetic procedures in the analysis of the pedigree of dogs

Abstract:

This work is a literature search on ways to evaluate populations and methods used to assess genetic diversity in populations with a focus on dog breeds. At the beginning of the thesis I explain why I think it is necessary to deal with genetic diversity and why it is so important. The whole first part of the work is devoted to definitions and explanations of basic terms used in the text of the work. I present the basic indices of genetic diversity (Hardy-Weinberg's law, inbreeding coefficient, Shannon-Wiener and Simpson index) in the population and methods of calculating these indices. I also deal with factors that directly determine genetic diversity, such as mutation pressure, selection pressure, migration, genetic drift, bottleneck effect and inbreeding. The second part of the work contains methods of researching genetic diversity and is divided into analyzes of genetic diversity using pedigrees and analyzes based on the study of genotype data of polymorphic microsatellite markers. From the results of various scientific studies and analyzes using available methods for assessing genetic diversity, I subjectively evaluate the pros and cons of these methods. I also analyze the causes of loss of genetic diversity and, based on exemplary studies, evaluate the correctness of the usual procedures in dog breeding.

Abstract:

Táto práca je literárnou rešeršou o spôsoboch vyhodnocovania populácií a metód využívaných pre hodnotenie genetickej diverzity v populácií so zameraním na plemená psov. V úvode práce vysvetľujem prečo si myslím že je nevyhnutné sa genetickou diverzitou zaoberať a prečo je tak dôležitá. Celá prvá časť práce je venovaná definíciám a vysvetleniu základných pojmov používaných v texte práce. Uvádzam základné indexy genetickej diverzity (Hardy-Weinbergov zákon, koeficient inbreedingu, Shannon-Wienerov a Simpsonov index) v populácií a metódy výpočtu týchto indexov. Rovnako sa venujem aj faktorom priamo určujúcim genetickú diverzitu, ako sú mutačný tlak, selekčný tlak, migrácia, genetický drift, bottleneck efekt a inbreeding. Druhá časť práce obsahuje metódy skúmania genetickej diverzity a je rozdelená na analýzy genetickej diverzity za pomoci rodokmeňov a na analýzy vychádzajúce zo skúmania údajov genotype polymorfných mikrosatelitných markerov. Z výsledkov rôznych vedeckých štúdií a analýz využívajúcich dostupné metódy hodnotenia genetickej diverzity subjektívne hodnotím klady a zápory daných metód. Rovnako rozoberám príčiny straty genetickej diverzity a na základe príkladných štúdií vyhodnocujem správnosť zaužívaných postupov v plemenitbe psov.

Keywords

inbreeding coefficient, dog, kinship mating, loss of genetic diversity

Klíčová slova

strata genetickej diverzity, koeficient inbreedingu, pes, príbuzenské párenie

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 4. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: prof. Ing. Luboš Vostrý, Ph.D.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů

Bakalářský studijní program / obor:
Zootechnika / Kynologie