Mgr. Vladimír Horský, Ph.D.
Doctoral thesis
Validace 3D struktur molekul
Validation of molecular 3D structures
Abstract:
Počítačové modely struktur biomakromolekul a jejich ligandů jsou předmětem výzkumu věd o živé přírodě. Některé modely však obsahují chyby zapříčiněné jejich experimentálním původem, jako například nepřesnou interpretací naměřených dat. Správci databáze Protein Data Bank (PDB), největší databáze těchto modelů, implementovali software pro komplexní validaci struktur, který pro každou strukturu produkuje …moreAbstract:
Computer models of structures of biomacromolecules and their ligands lie at the centre of research in modern life sciences. Unfortunately, some of these models contain various errors due to the experimental nature of processes utilised for their acquisition. These errors can, e.g. stem from incorrect interpretation of the measured data. Curators of the Protein Data Bank (PDB) database, the largest …moreKeywords
struktura biomakromolekul struktura ligandů model struktury validace Protein Data Bank shoda modelu s experimentálními daty rentgenová krystalografie geometrie molekuly ValTrendsDB LLDF biomacromolecular structure ligand structure structure model validation electron density fit X-ray crystallography molecular geometry
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 11. 7. 2022
Identifier:
https://is.muni.cz/th/qjqxn/
Thesis defence
- Date of defence: 8. 9. 2022
- Supervisor: doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- Reader: doc. RNDr. Karel Berka, Ph.D., doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceDoctoral programme / field:
Biomolecular chemistry and bioinformatics / Biomolecular chemistry and bioinformatics
Theses on a related topic
-
Souvislost jasnosti sebepojetí adolescentů s aktivním a pasivním užíváním Instagramu
Klára Černohorská -
Studium struktury proteinů pomocí rentgenové krystalografie
Martin Kollár -
Studium interakcí na zinku závislých nukleas s inhibitory pomocí rentgenové krystalografie a biofyzikálních metod
Kristýna Adámková