Bc. Pavlína Pokorná

Diplomová práce

Studium rozhraní mezi proteiny a nukleovými kyselinami pomocí QM/MM metody

Studies of interfaces between proteins and nucleic acids using the QM/MM method
Anotace:
Interakce proteinů s RNA jsou klíčové pro všechny fáze genové exprese a jejich regulaci. Strukturní dynamiku protein-RNA komplexů na atomární úrovni lze studovat výpočetní metodou molekulárně dynamických (MD) simulací. Nicméně díky zjednodušením použitým v molekulárně-mechanickém (MM) silovém poli, které popisuje molekulové interakce v MD, není popis simulovaných systémů vždy spolehlivý. Cílem této …více
Abstract:
Interactions of proteins with RNA play key roles in all stages of gene expression and its regulation. Structural dynamics of protein-RNA complexes can be studied on the atomic level with the computational method of molecular dynamics (MD) simulations. However, due to the approximations used in the molecular mechanics (MM) force field, which describes molecular interactions in MD, the description of …více
 
 
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 22. 6. 2018
  • Vedoucí: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
  • Oponent: doc. Mgr. Pavel Banáš, Ph.D.

Citační záznam

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta