Detekce patogenů rostlin molekulárně-genetickými metodami

Patricie Juránková

Bakalářská práce

Detection of plant pathogens by molecular genetic methods

Anotace:

V bakalářské práci Detekce patogenů rostlin molekulárně-genetickými metodami je charakterizován pojem „patogen fytoplazma“, je zde popsán způsob jeho přenosu, jednotlivé příznaky napadených druhů zeleniny a významné druhy patogenu. Práce se také zabývá detekcí a možnou ochranou proti těmto parazitům. Část práce je věnována konkrétně zelenině rajčeti, na které je tato práce zaměřena. Cílem bylo otestovat a následně prakticky aplikovat metody molekulární genetiky založené na principu PCR a elektroforetické separaci, sloužící k detekci fytoplazmy ve vzorcích rajčete. Bylo odebráno 20 vzorků listů rostlin rajčete vykazující příznaky fytoplazmy stolbur a 5 vzorků bez příznaků, které sloužily jako negativní kontrola. Následně byly tyto vzorky testovány metodami PCR a elektroforetickou separací na přítomnost dané fytoplazmy. Fytoplazma stolbur byla detekována u většiny vzorků s příznaky, až na dva. Dosažené výsledky jsou vyhodnoceny a je uvedeno doporučení pro praxi.

Abstract:

The bachelor's thesis Detection of plant pathogens by molecular genetic methods characterizes the term "phytoplasma pathogen", describes the method of its transmission, the individual steps of infested vegetable species, and important pathogen species. The work deals with the detection and possible protection against these parasites. Part of the work is devoted to a specific vegetable tomato, on which this work is focused. The aim was to test and then practically apply methods of molecular genetics based on the principle of PCR and electrophoretic separation, used to detect phytoplasma in tomato samples. Twenty samples of tomato plant leaves showing stolbur phytoplasma samples and 5 asymptomatic samples were taken as a negative control. Subsequently, these samples were tested by PCR methods and electrophoretic separation for the presence of the phytoplasma. Stolbur phytoplasma was detected in several but two sample samples. The achieved results are evaluated and practice recommendations are given.

Klíčová slova

rajče, fytoplazma, PCR, elektroforetická separace, detekce

Keywords

tomato, PCR, electrophoretic separation, detection, phytoplasma

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. Ing. Tomáš Vyhnánek, Ph.D.
• Oponent: Pavel Matušinsky, externi

Mendelova univerzita v Brně

Agronomická fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Agrobiologie / Molekulární biologie a biotechnologie