Ontologie biologických dat zaměřené na fotosyntézu

Mgr. Jana Pospíšilová

Bachelor's thesis

Biological data ontologies focused on photosynthesis

Anotácia:

Tato práce vznikla jako součást projektu e-photosynthesis. Jejím cílem bylo navrhnout a implementovat ontologickou databázi pojmů souvisejících s procesem oxidativní fotosyntézy a vytvořit uživatelsky přívětivé grafické rozhraní pro její editaci. Součástí práce je rovněž implementace nástrojů pro dávkovou aktualizaci databáze a export obsahu ontologie do souborů ve formátech OBO a OWL.

Abstract:

This thesis was developed as part of the e-photosynthesis project. The aim of the thesis was to design and implement an ontology database of terms associated with the process of oxygenic photosynthesis in green plants and algae, and to create a user-friendly graphical interface for its administration. There are also implemented tools for batch update of the database and for exporting the content of the ontology into the files written in OBO or OWL format, resp.

Kľúčové slová

ontologie, e-photosynthesis, bio–ontologie, OBO, OWL, ontologické databáze, bio–portály, fotosyntéza, oxidativní fotosyntéza

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 22. 6. 2010
• Vedúci: RNDr. David Šafránek, Ph.D.
• Oponent: Ing. Jan Červený

Masaryk University

Faculty of Informatics

Bachelor programme / odbor:
Applied Informatics / Applied Informatics