Viry řas a sinic

Klára PTOŠKOVÁ

Bachelor's thesis

Viruses of algae and cyanophyta

Abstract:

Viry jsou podstatnou a všudypřítomnou součástí vodního prostředí, ve kterém se účastní mnoha důležitých dějů. Koncentrace virových částic nalezených ve vodě je velmi vysoká v mořských i sladkovodních ekosystémech. Jejich pravděpodobně nejvýznamnějšími hostiteli jsou řasy a sinice. Jelikož jsou tito primární producenti ekologicky významné organismy, jejich virové infekce se projevují globálně. Viry snižují primární produkci, čímž dochází k přesměrování toku živin a tím ke změnám v potravních řetězcích i kolobězích organických látek. Intenzivně je zkoumána virová aktivita při výskytu sinicových vodních květů v řekách, jezerech, rybnících a vegetačního zákalu způsobeného převážně řasami v mořích. Zvýšený počet virů ve vodních květech a vegetačním zákalu byl mnohokrát dokázán a jejich zánik je s viry často spojován. Narůstající zájem o viry ve vodním prostředí napovídá, že se jedná o důležité biologické agens, které ovlivňují ekologicky významné děje i hostitele samotné. V bakalářské práci byla přítomnost virů detekována ve vzorcích obsahující sinice a řasy původem z České Republiky a Spojených států amerických. Byla využita nested PCR s primery AVS 1, AVS2 a POL. Sekvence pozitivních vzorků byly porovnány s dostupnými sekvencemi v databázi GenBank. Ve vzorcích z vodního prostředí byl potvrzen výskyt dvou virů. Ukázalo se, že použité primery jsou nespecifické, protože amplifikují i nevirovou DNA.

Abstract:

Viruses are ubiquitous and essential part of the aquatic environment where they are involved in many important processes. The concentration of viral particles found in water is very high in marine and freshwater ecosystems. Their probably the most important hosts are algae and cyanobacteria. Since these major producers are ecologically important organisms, their viral infections manifest themselves globally. Viruses reduce primary production, thereby redirecting the flow of nutrients and thus it leads to change in food webs and cycling of organic substances. Viral activity in the presence of cyanobacterial blooms in rivers, lakes, ponds and harmful algal blooms caused mainly by algea in the oceans is investigated intensively. Increased number of viruses in water blooms was provided many times and its demise is often associated with viruses. Growing interest in viruses in the aquatic environment suggests that they are important biological agents that affect environmentally important processes as well as their hosts. In this thesis the viruses were detected in samples containing cyanobacteria and algae originally from the Czech Republic and the United States. Nested PCR with primers AVS1, AVS2 and POL was used. Sequences of positive samples were compared with sequences avaible in the GenBank database. Two viruses were found and it was confirmed that the used primers are non-specific because they amplify also non-viral DNA.

Keywords

viry, řasy, sinice, Phycodnaviridae

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 4. 2015

Accessible from:: 30. 4. 2015

Thesis defence

• Supervisor: prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc.

PALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology