Studium exprese hostitelských a fágových genů během fágové infekce

Bc. Dominik Vrba

Bachelor's thesis

Control mechanisms of phage-host genes co-expression during phage infection

Anotácia:

Bakteriofágy představují nejrozšířenější skupinu virů žijících na planetě Zemi obývající různé ekosystémy. Fágy hrají významnou roli v evoluci bakteriálních hostitelů. Jelikož jsou schopny lyzovat široké spektrum bakteriálních patogenů představují významný terapeutický potenciál při léčbě mikrobiálních infekcí. V současné době jejich důležitost stoupá zvláště kvůli výskytu bakteriálních kmenů rezistentních k některým běžně používaným antimikrobiálním látkám. Studium interakcí mezi hostitelskou buňkou a fágem na genmické, transkriptomické a proteomické úrovni a jejich následků je důležité pro další terapeutické využití bakteriofágů. Neméně důležité je také pochopení funkce obranných systémů bakterie v rámci mechanismů ochrany před fágovou infekcí. Hlavní náplní práce je popsání změn v expresi genů hostitele a fága během infekce.

Abstract:

Bacteriophages represent the most widespread group of viruses living on the Earth inhabiting various ecosystems. Phages play a significant role in the evolution of bacterial hosts. As they are capable to lyse a broad spectrum of bacterial pathogens, they represent an important therapeutic potential in the treatment of microbial infections. At present their importance is rising especially due to the presence of resistant strains of bacteria against some commonly used antimicrobial agents. The study of interactions between the host cell and the phage at the genomic, transcriptomic and proteomic level and their consequences is important for further therapeutic use of bacteriophages. Equally important is the understanding of the function of bacterial defense systems within the mechanisms of protection against phage infection. The work is focused on description of changes in host and phage expression during infection.

Kľúčové slová

bakteriofág, interakce fág-hostitel, transkriptom, bakterie, Staphylococcus aureus, fágová terapie, rezistence, adsorpce, bacteriophage, phage-host interactions, transcriptome, bacteria, phage therapy, resistance, adsorption

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 7. 6. 2018
• Vedúci: Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Luděk Eyer, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics