Detekce strukturních změn v promotoru c-myc genu pomocí strukturních sond a polymerázové řetězové reakce.

Bc. Adéla KÖNIGOVÁ

Bachelor's thesis

Detection of structural changes in the c-myc promotor by structural probes and polymerace chain reaction.

Anotácia:

Bakalářská práce je literární rešerší. Zabývá se strukturními změnami DNA v promotoru c-myc genu a jejich detekcí. Sekvence promotoru může vytvářet lokální otevřené struktury DNA, mezi které patří triplexy a kvadruplexy. Práce se zejména zabývá strukturou a vznikem inter- a intramolekulárních triplexů, I-motivu a G-kvadruplexu. Chemické strukturní sondy nabízejí efektivní způsob jejich detekce a mají řadu výhod v porovnání s enzymatickými sondami. Literární rešerše pojednává o tom, za jakých podmínek ke strukturním změnám v promotoru c-myc genu dochází, jaké látky vzniklé struktury stabilizují a jakými sondami lze lokální struktury detekovat. V neposlední řadě se tato bakalářská práce zabývá biologickým významem strukturních změn.

Abstract:

This bachelor thesis is literature retrieval. It deals with structural changes of DNA in the promoter of c-myc gene and their detection. The promoter sequence can create local-open DNA structures including triplexes and quadruplexes. This work especially deals with structure and creation of inter- and intramolecular triplexes, I-motiv and G-quadruplex. Chemical structural probes offer effective way of their detection and have a lot of advantages compared to enzymatic probes. The literature retrieval deals with on which conditions structural changes in promoter are created, what kind of substances stabilize them and which probes can detect local structures. Last but not least this bachelor work is concerned with biological significance of structural changes.

Kľúčové slová

DNA, detekce, triplex, G-kvadruplex, I-motiv, chemické strukturní sondy

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 6. 2011

Zverejniť od: 24. 6. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 22. 8. 2011
• Vedúci: RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Chemistry / Chemie - Biologie (dvouoborové)