Studium částečně orientované podjednotky delta RNA polymerasy bakterie Bacillus subtilis s využitím NMR spektroskopie

Bc. Jiří Pol

Bakalářská práce

Study of partially oriented delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis using NMR spectroscopy

Anotace:

Tato práce se zabývá přípravou vzorku proteinu, N-terminální domény delta podjednotky RNA polymerázy bakterie Bacillus subtilis, v anisotropním prostředí pro měření reziduálních dipolárních interakcí pomocí NMR spektroskopie. Na začátku, ve druhé kapitole, obsahuje práce krátké shrnutí metody NMR spektroskopie a teorii nezbytnou k pochopení problematiky reziduálních dipolárních interakcí. V kapitole 3 nazvané Metody a materiál tato práce obsahuje popis přípravy vzorku, použité experimenty při měření spekter a programy využité k vyhodnocení získaných dat. Kapitola 4 popisuje vyhodnocování spekter, vypočtení reziduálních dipolárních interakcí a také ověření správnosti těchto experimentálních údajů. Nakonec jsou uvedeny a diskutovány získané výsledky.

Abstract:

This work deals with the preparation of a protein sample, the N-terminal domain of RNA polymerase delta subunit of Bacillus subtilis in the anisotropic environment for measurement of residual dipolar couplings by NMR spectroscopy. At the beginning, in the second chapter, it contains a brief summary of NMR spectroscopy and theory necessary for understanding of the residual dipolar couplings. In Chapter 3, entitled Methods and Materials, this work contains a description of sample preparation, experiments used for measuring the spectra and the programs used to evaluate the data obtained. Chapter 4 describes the evaluation of spectra, calculation of the residual dipolar interactions, and also verification of the accuracy of experimental data. Finally, the obtained results are presented and discussed.

Klíčová slova

NMR, reziduální dipolární interakce, delta podjednotka RNA polymerázy, orientované médium, residual dipolar couplings, delta subunit of RNA polymerase, oriented medium.

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 13. 6. 2011
• Vedoucí: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie