Genetická variabilita vybraných populací jedle bělokoré na území České republiky

Bc. Filip Pastierovič

Diplomová práce

Genetic diversity in selected populations of silver fir in the Czech Republic

Anotace:

Diplomová práce s názvem Genetická variabilita vybraných populací jedle bělokoré na území České republiky se zaměřuje na rozbor genetické variability deseti populací jedle bělokoré (Abies alba), u kterých je předpokládána autochtonnost. V rešeršní části je rozebrán druh jedle bělokorá, dále jsou popsány metody a postupy generování a analýzy molekulárních dat spolu s tématem genetické analýzy pomocí genetických markerů. Zájmové oblasti s analyzovanými populacemi se nacházejí v blízkosti lokalit: Novohradské hory, Zátoň – Kubova Huť, Vojířov, Albrechtice, Horní Blatná, Klášterec, Nižbor, Tanečná, Kychová, Stříbro a Frýdlant. Bylo odebráno celkem 252 vzorků. Z každé populace byl odebrán organický materiál obsahující DNA z 17 až 30 jedinců. Cílem práce je analyzovat, popsat a interpretovat genetickou strukturu vybraných zájmových populací a jedinců. K následným analýzám byla využita metoda genetických mikrosatelitových markerů. Bylo zjištěno, že vybrané populace jedle bělokoré vykazují na základě analýzy genetické vzdálenosti shlukovité uspořádání. Mezipopulační diverzita populací dosahuje hodnoty 3%.

Abstract:

Master thesis entitled Genetic diversity in selected populations of silver fir in the Czech Republic focuses on the analysis of the genetic variability of ten populations of silver fir (Abies alba), which are assumed to be autochtonous. A silver fir species is described in the research section. Methods of generating and analyzing molecular data are described, together with the topic of genetic analysis using genetic markers. Areas of interest with the analyzed populations are located near Novohradské hory, Zátoň - Kubova Huť, Vojířov, Albrechtice, Horní Blatná, Klášterec, Nižbor, Tanečná, Kychová, Stříbro and Frýdlant. A total of 252 samples were taken. From each population, organic material containing DNA from 10 to 30 individuals was collected. The aim of the thesis is to analyze, describe and interpret the genetic structure of selected interest populations and individuals. The genetic microsatellite marker method was used for subsequent analyzes. It has been found that selected populations of silver fir have a clustering arrangement based on the genetic distance analysis. Inter-population diversity is 3%.

Klíčová slova

jedle bělokorá, Abies alba, variabilita, genetická struktura, mikrosatelitové markery, SSRs

Keywords

silver fir, Abies alba, variability, SSRs, genetic structure, microsatellite markers

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Jiří Korecký, Ph.D.
• Oponent: Zuzana Bínová, Ing.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta lesnická a dřevařská

Magisterský studijní program / obor:
Lesní inženýrství / Lesní inženýrství