Analýza kvality a konformační závislosti atomových nábojů – Bc. Lukáš Petrusek
Bc. Lukáš Petrusek
Master's thesis
Analýza kvality a konformační závislosti atomových nábojů
Analysis of quality and conformational dependency of atomic charges
Abstract:
Parciální atomové náboje popisují elektronovou hustotu v rámci molekuly. Jedna z metod, která dokáže hodnoty nábojů vypočítat za zlomek času je metoda EEM (Electronegativity Equalization Method), která potřebuje ke svému výpočtu parametry. V této práci tak byla provedena rešerše dostupných parametrů pro EEM její modifikace. Bylo vybráno 14 článků, které obsahovaly dohromady 29 parametrů. Parametry …moreAbstract:
Partial atomic charges describe electron density in molecules. One of few approaches for a fast partial atomic charges computation is method called EEM (Electronegativity Equalization Method). This method needs parameters for the computation, so this why was done research of available parameters for EEM in the thesis. It has been choosen 14 articles containing 29 parameters. All of theese parameters …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2016
Identifier:
https://is.muni.cz/th/mkvto/
Thesis defence
- Date of defence: 21. 6. 2016
- Supervisor: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Atomové typy v metodách pro výpočet parciálních atomových nábojů
Radka Sedláková -
Parciální atomové náboje peptidů
Ondřej Schindler -
Parciální atomové náboje na proteinech
Ondřej Schindler -
Srovnání machine-learningových přístupů pro výpočet parciálních atomových nábojů
Jan Bříza -
Empirické metody pro výpočet parciálních atomových nábojů
Ondřej Schindler -
Backend pro databázi parciálních atomových nábojů
Miroslava Voglová -
Frontend pro databázi parciálních atomových nábojů
Dominik Toušek -
Implementace metod MGC a OGC pro výpočet parciálních atomových nábojů
Šimon Zouvala