Analýza kvality a konformační závislosti atomových nábojů – Bc. Lukáš Petrusek
Bc. Lukáš Petrusek
Diplomová práce
Analýza kvality a konformační závislosti atomových nábojů
Analysis of quality and conformational dependency of atomic charges
Anotace:
Parciální atomové náboje popisují elektronovou hustotu v rámci molekuly. Jedna z metod, která dokáže hodnoty nábojů vypočítat za zlomek času je metoda EEM (Electronegativity Equalization Method), která potřebuje ke svému výpočtu parametry. V této práci tak byla provedena rešerše dostupných parametrů pro EEM její modifikace. Bylo vybráno 14 článků, které obsahovaly dohromady 29 parametrů. Parametry …víceAbstract:
Partial atomic charges describe electron density in molecules. One of few approaches for a fast partial atomic charges computation is method called EEM (Electronegativity Equalization Method). This method needs parameters for the computation, so this why was done research of available parameters for EEM in the thesis. It has been choosen 14 articles containing 29 parameters. All of theese parameters …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2016
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/mkvto/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 21. 6. 2016
- Vedoucí: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Parciální atomové náboje peptidů
Ondřej Schindler -
Parciální atomové náboje na proteinech
Ondřej Schindler -
Atomové typy v metodách pro výpočet parciálních atomových nábojů
Radka Sedláková -
Srovnání machine-learningových přístupů pro výpočet parciálních atomových nábojů
Jan Bříza -
Backend pro databázi parciálních atomových nábojů
Miroslava Voglová -
Frontend pro databázi parciálních atomových nábojů
Dominik Toušek -
Empirické metody pro výpočet parciálních atomových nábojů
Ondřej Schindler -
Implementace metod MGC a OGC pro výpočet parciálních atomových nábojů
Šimon Zouvala