Dlouhé nekódující molekuly RNA u mnohočetného myelomu

Bc. Barbora Gromesová

Master's thesis

Long non-coding RNA molecules in multiple myeloma

Abstract:

Dlouhé nekódující molekuly RNA reprezentují pravděpodobně nejrozsáhlejší skupinu nekódujících RNA, zároveň ale představují nejméně prostudovanou skupinu molekul. Dysregulovaná exprese dlouhých nekódujících molekul RNA byla již popsána u nejrůznějších patologických stavů, což naznačuje, že by mohly být zapojeny do patogeneze mnoha onemocnění, včetně těch nádorových. Tato diplomová práce se zaměřuje na dlouhé nekódující molekuly RNA u mnohočetného myelomu, který je druhou nejčastější hematologickou malignitou a zároveň se jedná o těžko léčitelné onemocnění. Cílem diplomové práce bylo stanovit expresní profil dlouhých nekódujících molekul RNA u pacientů s mnohočetným myelomem a u zdravých dárců pomocí metody kvantitativní real time PCR. Studie odhalila 3 dlouhé nekódující molekuly RNA UCA1, NEAT1 a BDNF-AS, které byly signifikantně odlišně exprimovány u pacientů s mnohočetným myelomem v porovnání se zdravými dárci. UCA1 byla signifikantně snížená u pacientů s mnohočetným myelomem ve srovnání se zdravými dárci, a hladina její exprese dokázala odlišit pacienty s mnohočetným myelomem od zdravých dárců s 95,24 % senzitivitou a 75 % specificitou. NEAT1 a BDNF-AS byly signifikantně zvýšené u pacientů s mnohočetným myelomem ve srovnání se zdravými dárci, a dokázaly odlišit pacienty s mnohočetným myelomem od zdravých dárců se 100 % senzitivitou i specificitou. U mnohočetného myelomu zatím nebyly role těchto dlouhých nekódujících molekul RNA objasněny, nicméně tyto výsledky naznačují jejich zapojení do patogeneze tohoto onemocnění.

Abstract:

Long non-coding RNAs likely represent the largest group of non-coding RNA molecules but they are also the least-studied group of molecules. Dysregulated expression of long non-coding RNAs has been described in a variety of pathological conditions, suggesting that they could be involved in pathogenesis of many diseases, including cancer. This thesis is focused on the long non-coding RNAs in multiple myeloma, which is the second most common hematological malignancy and a hard-to-treat disease. The aim of the thesis was to analyze expression profile of long non-coding RNAs in multiple myeloma patients and healthy donors using quantitative real-time PCR. The study revealed three long non-coding RNAs: UCA1, NEAT1 and BDNF-AS, which were significantly differentially expressed in multiple myeloma patients compared to healthy donors. UCA1 was significantly decreased in multiple myeloma patiens when compared to healthy donors and was able to distinguish multiple myeloma patients from healthy donors with 95.24% sensitivity and 75% specificity. NEAT1 and BDNF-AS were significantly increased in multiple myeloma patients when compared to healthy donors, and both distinguished multiple myeloma patients from healthy donors with 100% sensitivity and 100% specificity. So far, the role of these long non-coding RNAs has not been elucidated in the pathogenesis of multiple myeloma but these results suggest their involvement in the pathogenesis of this disease.

Keywords

Dlouhé nekódující molekuly RNA, mnohočetný myelom, dysregulace lncRNA, qPCR, long non-coding RNA molecules, multiple myeloma, lncRNA dysregulation

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 9. 5. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 6. 6. 2016
• Supervisor: doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics