Řešení struktur serpinů IRS-1 a IRS-4 z \kur{Ixodes ricinus}

Bc. Rudolf BINDER

Master's thesis

Anotácia:

Diplomová práce se zabývá určením struktur serpinů Iripin-1 (zastarale IRS-1) a Iripin-4 (zastarale IRS-4). Teoretická část poskytuje informace o klíštěti Ixodes ricinus a serpinech. O serpinech je uveden především jejich speciální mechanismus inhibice proteáz a jejich role v klíštěcí biologii a krmení. Ve druhé polovině je vysvětlen princip a proces určování proteinové struktury. Experimentální část ukazuje data z rentgenové difrakce, její zpracování a také rafinaci a validaci obou struktur. Výsledky jsou podloženy četnými parametry, tabulkami a obrázky struktur Iripinu-1 a Iripinu-4. Nakonec jsou obě struktury mezi sebou porovnány.

Abstract:

The master thesis deals with determination of structures of serpins Iripin-1 (formerly IRS-1 and Iripin-4 (formerly IRS-4). The theoretical part gives information about Ixodes ricinus and serpins. About serpins, their special mechanism of inhibition of proteases and their role in tick biology and feeding are also discussed. In the second half, the principle of protein structure determination is explained. The experimental part shows results of diffraction data processing and also refinement and validation of both structures. The results provide numerous parameters, tables and images of structures. Lastly, both structures are compared to each other.

Kľúčové slová

Struktura proteinů, Serpiny, Ixodes ricinus, Rentgenová krystalografie, Iripin-1, Iripin-4

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 4. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Mgr. Barbora Kaščáková, Ph.D.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Secondary Schools Teacher Training / Chemistry - Matematics