Počítačové modelování interakcí lektinů a sacharidů – Bc. Jan Ryška
Bc. Jan Ryška
Diplomová práce
Počítačové modelování interakcí lektinů a sacharidů
Computational modeling of lectin-saccharide interactions
Anotace:
Interakce mezi proteiny a sacharidy hrají klíčovou roli v mnoha biologických procesech jako je například odstraňování glykoproteinů z krevního oběhu, buněčné rozpoznávání, interakce buněk imunitního systému nebo nádorové bujení a tvorba metastáz. Tato práce zkoumá možnosti studia interakcí mezi lektiny a sacharidy pomocí metod molekulového modelování. Bylo zjištěno, že testované programy pro molekulové …víceAbstract:
Lectin-saccharide recognition is a crucial step in many biological processes such as clearance of glycoproteins from the circulatory system, cell-cell recognition, cell interactions in the immune system as well as pathological processes like metastasis. In this study, lectin-saccharide interactions were characterised by tools of molecular modeling such as molecular docking, molecular dynamics and binding …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2014
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/pwd02/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 5. 2. 2015
- Vedoucí: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biomolekulární chemie
Práce na příbuzné téma
-
Molekulová dynamika a výpočty volných energii mono a di-nukleotidových analogů s potenciálním antibiotickým účinkem
Hana Zigová -
Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin
Barbora Benešová -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Nové metody výpočtů volných energií pro studium interakcí protein-ligand
Daniela Toulcová -
Výpočet interakční energie amfifilních peptidů
Daniel Jaroň -
Výpočet väzobného profilu volnej energie formovania proteínových dimérov.
Ján Tungli -
Stanovení volné povrchové energie vybraných pevných látek metodou sedící kapky
Hynek Ondráček -
Design of new bioactive molecules using deep generators and molecular docking
Michal Punčochář