Analýza a identifikácia lokálnych štruktúr DNA

Michal Petrovič

Diplomová práce

Analýza a indentifikace lokálních struktur DNA

Anotace:

Diplomová práce se zaměřuje na návrh a implementaci nových analýz do webové aplikace DNA Analyzer. Aplikace slouží k identifikaci a analýze DNA struktur. Cílem práce je rozšířit platformu o nástroje specializované na identifikaci Z-DNA konformací a CpX ostrovů. Práce se zabývá také restrukturalizací, modernizací a nasazením aplikace na produkční server pomocí technologie kontejnerů.

Abstract:

This thesis focuses on designing and implementing new analysis features into the web application DNA Analyser. The application is designed for the identification and analysis of DNA structures. The goal is to expand the platform with tools specialized for identifying Z-DNA conformations and CpX islands. The thesis also addresses restructuring, modernizing, and deploying the application on a production server using container technology.

Abstract:

Diplomová práca sa zameriava na návrh a implementáciu nových analýz do webovej aplikácie DNA Analyser. Aplikácia slúži na identifikáciu a analýzu DNA štruktúr. Cieľom,práce je rozšíriť platformu o nástroje špecializované na identifikáciu Z-DNA konformácií a CpX ostrovčekov. Práca sa zaoberá aj reštrukturalizáciou, modernizáciou a nasadeniu aplikácie na produkčný server pomocou technológie kontajnerov.

Klíčová slova

CpG ostrovčeky, DNA struktury, Z-DNA, dockerizace, DNA analýza, bioinformatika, modulární architektura

Keywords

DNA analysis, CpG islands, DNA structures, bioinformatics, Z-DNA, modular architecture, dockerization

Klíčová slova

modulárna architektúra, DNA anlýza, DNA štruktúry, dockerizácia, Z-DNA, CpG ostrovčeky, bioinformatika

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 6. 2024
• Vedoucí: prof. RNDr. Ing. Jiří Šťastný, CSc.
• Oponent: Oldřich Trenz, doc. Ing.

Mendelova univerzita v Brně

Provozně ekonomická fakulta

Magisterský studijní program / specializace:
Otevřená informatika / Zaměření pro Otevřenou informatiku