Využití molekulárních markerů ve šlechtění mrkve

Bc. Darina Sejbalová

Master's thesis

Use of molecular markers in carrot breeding

Abstract:

Cílem této práce bylo studium diverzity mrkve obecné (Daucus carota), analýza homogenity rodičovského materiálu, vyhodnocení úspěšnosti křížení, a rozlišení sterilních a fertilních genotypů použitých křížení. Byly analyzovány 4 hybridní odrůdy mrkve a 12 linií, z nichž čtyři byly cytoplasmaticky sterilní (CMS), pomocí deseti SSR markerů a šesti markerů na CMS. Podle vypočítaných statistických hodnot DI, PI a PIC byly použité markery vysoce variabilní. Bylo pomocí nich detekováno celkem 45 alel, s průměrem 4,5 alel na lokus a 4 nulové alely. Velikost alel se pohybovala mezi 180 až 380 bp. Byla vyhodnocena úspěšnost křížení, kdy jako nejúspěšnější bylo vyhodnoceno křížení u odrůdy Koloseum. Čtyři SSR markery byly doporučeny jako vhodné pro další studium diverzity a úspěšnosti křížení u mrkve, a to GSSR-6, GSSR-16, GSSR-91 a GSSR-9. Pomocí markerů pro CMS proběhla úspěšně identifikace sterilních a fertilních linií u jednoho křížení (odrůda Koloseum) s markerem Atp8.

Abstract:

The aim tis work was study of diversity in carrot (Daucus carota), the analysis of the homogeneity of the parent material, the evaluation of the success of the crossing, and the resolution of the sterile and fertile genotypes of the samples used in crossing. Four hybrid carrot varieties and 12 lines were analyzed, four of which were sterile (CMS), with ten SSR markers and six CMS markers. Based on the calculated statistical values of DI, PI and PIC, the markers were highly variable. A total of 45 alleles were detected, with a mean of 4.5 alleles per locus and 4 zero alleles. The size of the allele ranged between 180 and 380 bp. The success rate of the crossing was evaluated, when the crossing of the Koloseum variety was evaluated as the most successful. Four SSR markers have been recommended as suitable for further study of the diversity and success rate of carrot crosses, namely GSSR-6, GSSR-16, GSSR-91 and GSSR-9. CMS markers successfully identified the sterile and fertile lines at one crossing (variety Koloseum) by Atp8 marker.

Keywords

genetická diverzita, DNA polymorfismus, SSR markery, úspěšnost křížení, Daucus carota, CMS

Keywords

Daucus carota, CMS, genetic diversity, polymorphism of DNA, SSR markers, success of the crossing

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 26. 4. 2018

Thesis defence

• Supervisor: doc. Ing. Tomáš Vyhnánek, Ph.D.
• Reader: Helena Stavělíková, externi

Mendel University in Brno

Faculty of AgriSciences

Master programme / field:
Plant Production / Plant Biotechnology