Segregační analýza za účelem identifikace pohlavně vázaných genů na základě NGS dat – Bc. Monika Michalovová
Bc. Monika Michalovová
Diplomová práce
Segregační analýza za účelem identifikace pohlavně vázaných genů na základě NGS dat
Segregation analysis with goal to identify sex-linked genes based on NGS data
Anotace:
Sekvenační data jsou dnes široce využívaná jak ve výzkumu, tak v diagnostice. V rámci této diplomové práce byla vytvořena sada skriptů, která slouží k detekci pohlavně vázaných genů na základě klasické segregační analýzy s využitím sekvenačních dat nové generace. Proces je plně automatizovaný, vedoucí od miliónů krátkých sekvencí (čtení) ke kandidátním pohlavně vázaným genům, které mohou být dále ověřeny …víceAbstract:
Sequencing data are extensively used nowadays in both research and diagnostics. In this diploma thesis a new pipeline has been established that is capable of discovering new sex-linked genes based on classical segregation analysis, using next-generation sequencing data. The pipeline is fully automated, leading from millions of short sequences (reads) to candidate sex-linked genes that can be further …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 27. 5. 2013
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/x3ogi/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 26. 6. 2013
- Vedoucí: doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc.
- Oponent: Mgr. Jan Bartoš, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Aplikovaná informatika / Bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Identifikace genů vázaných na pohlavní chromozomy u Silene latifolia a Silene dioica
Zuzana Machálková -
Charakterizace genů a repetitivní DNA u Rumex acetosa - dvoudomé rostliny s pohlavními chromosomy
Viktor Tokan -
Charakterizace genů a repetitivní DNA u Rumex acetosa - dvoudomé rostliny s pohlavními chromosomy
Viktor Tokan -
Analýza patogenních genetických variant u dětí s mentálními retardacemi pomocí metod komparativní genomové hybridizace na mikročipech (array-CGH) a sekvenování "nové generace" (NGS)
Markéta Wayhelová -
Isocitrát dehydrogenáza u difúzních gliomů: mutační analýza genů IDH1/2 pomocí sekvenování nové generace (NGS)
Kateřina Zettlová -
Scheduling software for the parallel running of NGS analytical pipelines
Nicolas Mokriš -
Analýza plastidových genomů rostlin z NGS dat a její aplikace
Kateřina Beková -
Analýza složení ruminální bakteriální mikroflóry pomocí NGS analýzy
Petra Halašková