Segregační analýza za účelem identifikace pohlavně vázaných genů na základě NGS dat – Bc. Monika Michalovová
Bc. Monika Michalovová
Master's thesis
Segregační analýza za účelem identifikace pohlavně vázaných genů na základě NGS dat
Segregation analysis with goal to identify sex-linked genes based on NGS data
Abstract:
Sekvenační data jsou dnes široce využívaná jak ve výzkumu, tak v diagnostice. V rámci této diplomové práce byla vytvořena sada skriptů, která slouží k detekci pohlavně vázaných genů na základě klasické segregační analýzy s využitím sekvenačních dat nové generace. Proces je plně automatizovaný, vedoucí od miliónů krátkých sekvencí (čtení) ke kandidátním pohlavně vázaným genům, které mohou být dále ověřeny …moreAbstract:
Sequencing data are extensively used nowadays in both research and diagnostics. In this diploma thesis a new pipeline has been established that is capable of discovering new sex-linked genes based on classical segregation analysis, using next-generation sequencing data. The pipeline is fully automated, leading from millions of short sequences (reads) to candidate sex-linked genes that can be further …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 27. 5. 2013
Identifier:
https://is.muni.cz/th/x3ogi/
Thesis defence
- Date of defence: 26. 6. 2013
- Supervisor: doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc.
- Reader: Mgr. Jan Bartoš, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
MICHALOVOVÁ, Monika. \textit{Segregační analýza za účelem identifikace pohlavně vázaných genů na základě NGS dat}. Online. Master's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Informatics. 2013. Available from: https://theses.cz/id/uijjf0/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Applied Informatics / Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Identifikace genů vázaných na pohlavní chromozomy u Silene latifolia a Silene dioica
Zuzana Machálková -
Charakterizace genů a repetitivní DNA u Rumex acetosa - dvoudomé rostliny s pohlavními chromosomy
Viktor Tokan -
Charakterizace genů a repetitivní DNA u Rumex acetosa - dvoudomé rostliny s pohlavními chromosomy
Viktor Tokan -
Analýza patogenních genetických variant u dětí s mentálními retardacemi pomocí metod komparativní genomové hybridizace na mikročipech (array-CGH) a sekvenování "nové generace" (NGS)
Markéta Wayhelová -
Isocitrát dehydrogenáza u difúzních gliomů: mutační analýza genů IDH1/2 pomocí sekvenování nové generace (NGS)
Kateřina Zettlová -
Scheduling software for the parallel running of NGS analytical pipelines
Nicolas Mokriš -
Analýza plastidových genomů rostlin z NGS dat a její aplikace
Kateřina Beková -
Využití technologie NGS pro analýzu genů spjatých s primárními imunodeficienciemi
Markéta Hrabálková