Trombotické a aterogenní genetické predispozice u polyglobulických dárců krve a krevních složek

Nikola Slaninová

Master's thesis

Thrombotic and Atherogenic Genetic Predisposition in Polyglobulic Donors of Blood and Blood Components

Abstract:

V této diplomové práci jsou zpracovány výsledky genetických hematologických vyšetření pacientů (majoritní skupinu tvoří muži), kteří mají predispozice k ateroskleróze a žilním trombózám, ale neprojevuje se u nich primární myeloproliferativní onemocnění, jako je Polycytemia vera, charakteristické mutací JAK V617F. Pro analýzu je využita homogenní skupina 199 jedinců, jejichž genetická vyšetření poskytla nemocnice Nový Jičín. Výsledky práce hodnotí, proč si část mužské populace vytváří trvale vysoké hladiny hemoglobinu v krvi, bez diagnózy myeloproliferativní choroby a jak s tím souvisí vyšetřované parametry aterogenní a trombogenní z hlediska heterozygozity a homozygozity nebo věku. Pro zpracování dat je využit dataminingový program Rapid Miner, umožňující tvorbu kontingenčních matic a interaktivní programové prostředí MATLAB. Největším přínosem studie jsou skupiny endoteliální ischémie, kardiovaskulární trombogenní dysfunkce, metabolická homocysteinová trombogenní dysfunkce, trombogenéza a trombolýza a receptorový endoteliální tromboembolismus. V práci je popsán predikční model záchytu rizikových dárců dle vytvořené klasifikace pomocí rozhodovacího stromu a vytvořeno grafické uživatelské rozhraní pro zjednodušení interpretace výsledků.

Abstract:

The results of genetic haematological examinations are processed in this diploma thesis. The majority group of patiens consists of men. Examined patiens are predisposed to have atherosclerosis and venous theombosis, but do not show primary myeloproliferative diseases such as Polycytemia vera characterized by JAK V617F mutation. A homogeneous group of 199 individuals whose genetic testing was provided by the Nový Jičín Hospital is used for the analysis. The results of the work evaluate why a portion of the male population consistently produces high hemoglobin levels in their blood, without the diagnosis of myeloproliferative disease, and how the investigated parameters are atherogenic and thrombogenic in terms of heterozygosity and homozygosity or age. A data mining program Rapid Miner is used for data processing, enabling the creation of contingency matrices. The greatest contributions of the study are the groups of endothelial ischemia, cardiovascular thrombogenic dysfunction, metabolic homocysteine thrombogenic dysfunction, thrombogenesis and thrombolysis, and receptor endothelial thromboembolism. Predictive model of risk donor capture is described in this work, the model was created according to previously created classification and is based on a decision tree. Graphical user interface was also created in this work to simplify the interpretation of results.

Keywords

Polycytemia vera, eNOS, JAK2, Rozhodovací strom, Rapid Miner

Keywords

Polycythemia vera, eNOS, JAK2, Decision Tree, Rapid Miner

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 4. 2019

Thesis defence

• Date of defence: 31. 5. 2019
• Supervisor: Iveta Bryjová
• Reader: David Elsnic

VŠB - Technical University of Ostrava

Fakulta elektrotechniky a informatiky

Master programme / field:
Elektrotechnika / Biomedicínské inženýrství