Multiplatformni 3D editor molekularnich struktur

Bc. Jakub Štěpán, Ph.D.

Diplomová práce

Multiplatform 3D molecular structure editor

Anotace:

V předložené práci je prezentován vývoj a funkce multiplatformního 3D editoru molekulárních struktur. V diplomove práci jsou rozebrány teoretické podklady důležité pro pochopení problematiky zobrazování a editace molekul. Dále je diskutována součastná nabídka softwarových nástrojů s podobným zaměřením. Diskutovány jsou také programovací techniky, jazyky a vybrané knihovny s ohledem na vytvořenou aplikaci. Součástí práce je rozsáhlý popis funkcí vytvořeného programu Nemesis. Program Nemesis je schopen editovat a stavět molekulární struktury, měřit jejich geometrické vlastnosti a používat různé další nástroje. Tyto nástroje jsou implementovány formou pluginů, což zaručuje flexibilitu pro budoucí rozšíření. Popis struktury a implementace zdrojového kódu je také v práci diskutován.

Abstract:

In this work, the development and functionality of multiplatform 3D editor of molecular structures is presented. The thesis describes important bases for molecular structure visualizations and editing. It also reviews current software tools with similar purposes. Programming techniques, languages, and libraries are briefly discussed with the main focus towards developed application. The developed Nemesis application functionality is described in details. The Nemesis is able to build molecular structure, measure geometry propetries, and the structure can be avaluated by various tools. Tools are implemented via plugins, which guarantee flexibility in further extensions. The implementation details are also mentioned.

Keywords

molecule editor, moleculer builder, molecular structure, molecular models, editor/builder molekul, molekulární struktura, molekulové modely.

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 5. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2009
• Vedoucí: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biomolekulární chemie