Vliv sekvence transmembránových domén na průchod peptidů přes membrány – Bc. Ladislav Bartoš
Bc. Ladislav Bartoš
Master's thesis
Vliv sekvence transmembránových domén na průchod peptidů přes membrány
Influence of various transmembrane domains on peptide translocation across membranes
Abstract:
V této diplomové práci pomocí počítačových simulací s využitím hrubozrnných modelů studujeme usnadněný průchod amfifilních peptidů skrz biologické membrány. Nejprve odhalujeme vliv α-helikálních transmembránových peptidů nebo proteinových domén s různými vlastnostmi na průchod peptidů přes biologické membrány. Poté navazujeme studiem kooperativního průchodu dvou peptidů. Naše výsledky značí, že transmembránové …moreAbstract:
In this diploma thesis, we study the facilitated translocation of amphiphilic peptides across biological membranes using computer simulations with coarse-grained models. First, we unravel the effect of α-helical transmembrane peptides or protein domains with various properties on the peptide translocation across the biological membranes. We follow up with a study of cooperative translocation of two …moreKeywords
antimikrobiální peptidy antimicrobial peptides peptidy penetrující buněčné membrány cell-penetrating peptides buněčná membrána cell membrane translokace translocation transmembránové proteiny transmembrane proteins scramblasy scramblases molekulová dynamika molecular dynamics Monte Carlo umbrella sampling Wangova-Landauova metoda Wang-Landau method volná energie free energy
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 1. 6. 2021
Identifier:
https://is.muni.cz/th/uwgeo/
Thesis defence
- Date of defence: 24. 6. 2021
- Supervisor: doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.
- Reader: Hector Martinez-Seara Monne
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Biomolecular chemistry
Theses on a related topic
-
Průchod komplexních peptidů přes fosfolipidové membrány
Ladislav Hustý -
Vliv transmembránových proteinů na průchod peptidů přes fosfolipidové membrány
Ladislav Bartoš -
Průchod komplexních peptidů přes fosfolipidové membrány
Ladislav Hustý -
Vliv transmembránových proteinů na průchod peptidů přes fosfolipidové membrány
Ladislav Bartoš -
Vliv transmembránových proteinů na průchod peptidů přes fosfolipidové membrány
Ladislav Bartoš -
Příprava a analýza nových linií transgenního ječmene exprimujících rekombinantní antimikrobiální peptidy.
Edita HOLÁSKOVÁ -
Vývoj metody pro purifikaci a kvantifikaci silně bazického peptidu apidaecinu. Analýza hladiny včelích antimikrobiálních peptidů a jejich biologických souvislostí.
Jiří DANIHLÍK -
Biologicky aktivní peptidy v reakci na stresové podmínky včely medonosné (Apis mellifera)
Jakub ROZHON