Zpět na vyhledávání

Bc. Barbora Knappeová

Bakalářská práce

Počítačové simulace strukturní dynamiky guaninových kvadruplexů

Molecular simulations of structural dynamics of guanine quadruplexes
Anotace:
Tato bakalářská práce se zabývá vlastnostmi a vyhodnocováním dynamiky paralelních guaninových kvadruplexů v all-anti konformaci s posunutým sloupcem guaninů. Provedli jsme molekulově dynamické simulace kvadruplexů se sníženým počtem guaninových tetrád v explicitním solventu a přítomnosti iontů, které měly stabilizovat strukturu, případně vyvolat sbalení těchto struktur. Zkoumali jsme i interakce DNA …více
Abstract:
This bachelor's thesis deals with the properties and dynamics evaluation of guanine quadruplexes in the all-anti conformation with a shifted guanine column. We performed molecular dynamic simulations of quadruplexes with reduced number of guanine quartets in an explicit solvent and the presence of ions, which were supposed to stabilize the structure or induce refolding. Interactions of DNA with ions …více
 

Klíčová slova

DNA guanin kvadruplexy molekulové modelování dynamika molekul guanine quadruplexes molecule modelling dynamics of molecules
 
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 31. 5. 2023
Identifikátor: https://is.muni.cz/th/yg4d3/

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 29. 6. 2023
  • Vedoucí: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
  • Oponent: RNDr. Miroslav Krepl, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
Složka Odkaz na adresář do lokálního úložiště instituce